[发明专利]一种鸡哥伦比亚羽基因型的检测引物、检测试剂盒、检测方法及应用

说明书

本发明涉及一种鸡哥伦比亚羽基因型的检测引物、检测试剂盒、检测方法及应用，属于动物遗传育种技术领域。本发明中发现RAI14基因上游区域序列中第33‑95位63bp碱基序列的插入与鸡哥伦比亚羽性状具有密切的联系，因此本发明中利用RAI14基因上游区域的的特点，建立了针对该插入的PCR基因分型方法，进而可以对哥伦比亚羽鸡基因进行分型。本发明所提供的鸡哥伦比亚羽基因型的检测方法操作简单、检测快速、结果准确，有利于在育种实践中更有效、快速地对哥伦比亚羽性状进行选择，加快育种进展，节约育种成本，为哥伦比亚羽鸡性状的选育提供快捷的分子选育方法。

技术领域

本发明涉及一种鸡哥伦比亚羽基因型的检测引物、检测试剂盒、检测方法及应用，属于动物遗传育种技术领域。

背景技术

鸡的羽色十分丰富，是鸡的重要品种特征之一，也是鸡育种工作中一项重要选择指标。鸡的浅芦花羽也叫哥伦比亚羽，具体表现为：羽毛外观主体基本为白羽，颈部、翼部和尾部的羽毛末端有黑色横斑呈横斑浅芦花状，其为性连锁哥伦比亚羽。伴性哥伦比亚羽由于其特点鲜明，伴性遗传，获得了更多的关注和研究。

哥伦比亚羽作为一种性状，表现在豫粉1号H系中，国外具有哥伦比亚色洛克鸡。2004年开始，连续2年利用引进的巴布考克B-380祖代C系公鸡的混合精液，与固始鸡原始群体中哥伦比亚母鸡进行级进杂交，从中选出哥伦比亚羽的公母鸡，然后进行横交固定，闭锁繁育，获得豫粉1号鸡。自2008年开始又分快羽、慢羽进行家系选育，其中H系为快羽系、N系为慢羽系。鸡的羽色为质量性状，受众多基因控制，其遗传也是一个复杂的过程，目前没有较好的检测鸡哥伦比亚羽基因型的方法。

发明内容

本发明的目的是提供一种鸡哥伦比亚羽基因型的检测引物，能够较好的检测鸡的哥伦比亚羽基因型。

本发明还提供了鸡哥伦比亚羽基因型的检测试剂盒，能够用于检测鸡的哥伦比亚羽基因型。

本发明还提供了鸡哥伦比亚羽基因型的检测方法，能够检测出鸡的哥伦比亚羽基因型。

本发明还提供了上述鸡哥伦比亚羽基因型的检测方法的应用，为鸡哥伦比亚羽品种的育种提供了一种新方法。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种鸡哥伦比亚羽基因型的检测引物，所述检测引物的PCR扩增序列覆盖如SEQID NO.1所示序列的第33-95位。

如SEQ ID NO.1所示序列为RAI14基因上游区域序列，RAI14基因全称为维甲酸诱导蛋白14基因，是首先在肝脏中鉴定的肌动蛋白结合蛋白。在人体内，RAI14基因在外质特化中发挥肌动蛋白调节作用，对于精子极性的建立和正常精子细胞的粘附极其重要，也可能促进血睾屏障的Sertoli细胞紧密连接的完整性；在鸡体内，RAI14基因位于Z染色体上，有2个转录物(剪接变体)。本发明中发现RAI14基因上游区域序列第33-95位63bp碱基序列的插入与鸡哥伦比亚羽性状具有密切的联系，属于鸡伴性哥伦比亚羽基因，因此本发明中利用RAI14基因上游区域的63bp碱基序列插入的特点，建立了针对该插入的PCR基因分型方法，进而可以对哥伦比亚羽鸡基因进行分型。

优选的，所述检测引物的核苷酸序列如下所示：

上游引物P-F：5′-CGTATACACAGCCTGGCCTAA-3′(如SEQ ID NO.3所示)；

下游引物P-R：5′-ATTCCTGTGTGTGGTGGAGTG-3′(如SEQ ID NO.4所示)。

上述引物扩增片段的大小分别为257bp或者194bp，257bp为63bp碱基序列插入，为Z^H型；194bp为63bp碱基序列缺失，为Z^h型。