[发明专利]一种靶向Ang-2基因抑制肺癌细胞的特异性shRNA的筛选方法有效
申请号: | 201710367068.7 | 申请日: | 2017-05-23 |
公开(公告)号: | CN107142310B | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
发明(设计)人: | 陈建荣;姚敏;董志珍;杨绪莉;王理;姚登福 | 申请(专利权)人: | 南通市第一人民医院;南通大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/02;G01N33/574 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 陈娟 |
地址: | 226001 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 靶向 ang 基因 抑制 肺癌 细胞 特异性 shrna 筛选 方法 | ||
1.一种靶向Ang-2(血管生成素-2)基因抑制肺癌细胞的特异性shRNA的筛选方法,其特征在于:经细胞复苏、细胞培养、细胞转染、干扰前后实时荧光定量PCR检测Ang-2表达、干扰前后细胞中蛋白表达分析、CCK-8方法检测干扰Ang-2基因前后的肺癌细胞增殖能力及干扰前后细胞侵袭、迁移能力改变的检测的步骤完成对特异性shRNA的筛选;筛选出最优特异性shRNA的shRNA-1,所述shRNA-1的序列为:TTACTCA TTGTATGAACAT;
所述干扰前后实时荧光定量PCR检测Ang-2表达具体步骤包括Total RNA提取、逆转录cDNA和荧光定量RT-PCR;
其中,所述干扰前后细胞中蛋白表达分析的具体步骤为:
a.蛋白抽提和浓度测定:PBS冲洗贴壁细胞两遍后,加适量含1%的PMSF及磷酸酶抑制剂的裂解液,冰上裂解15min,用刮板收集细胞,在4℃ 12000r/min环境下离心20min,以BCA法测定浓度;按SDS-PAGE蛋白上样缓冲液体积:蛋白体积=1:4的比例加入蛋白上样缓冲液,并于100℃煮5min,使蛋白变性;所收集到的变性蛋白立即使用或-80℃保存待用;
b.Western blotting免疫印迹试验:
制备10%SDS聚丙烯酰胺凝胶分离胶和5%浓缩胶,所述分离胶的配方为:ddH2O 1.3 mL,1mol/L PH8.8 Tris-HCl 1.9 mL,30% Arc- Bis 1.7 mL,10% SDS 50 μl,TEMED 2 μl及10%过硫酸铵 50 μl;所述浓缩胶的配方为:ddH2O 1.4 mL,1 mol/L pH 6.8 Tris-HCl0.25 mL,30% Arc-Bis 0.33 mL,10% SDS 20 μl,TEMED 2 μl及10%过硫酸铵AP 20 μl;
向电泳槽内加入足量电泳缓冲液,所述电泳缓冲液的配方为:SDS 1g,Tris 3.02 g,甘氨酸 14.4 g,ddH2O 1 000 mL;
调节所收集的变性蛋白浓度和每个孔上样体积,使每孔上样总量达200μg进行电泳;电泳恒压80 V×40 min,后100 V×1h;
电泳结束后将切好的SDS聚丙烯酰胺凝胶分离胶放入转膜槽内,加入800ml转膜缓冲液进行转膜,恒流300 mA×2h;所述转膜缓冲液的配方为Tris 3.02 g,甘氨酸 14.4 g,ddH2O600 mL,100%甲醇200 mL;
待蛋白转移至PVDF膜后拿出,使用TBST缓冲液漂洗5 min,共漂洗4次,所述TBST缓冲液的配方为:NaCl 8.0 g,Tris 2.42 g,Tween-20 0.5 mL,ddH2O 1000 mL;室温下,封闭液脱色摇床封闭1 h;
TBST缓冲液漂洗5 min,共漂洗3次,加入1:1000的兔抗人Ang-2 、1:200倍的鼠抗人E-cadherin、1:2000倍的鼠抗人VIM、1:500倍的鼠抗人Snail、1:200倍的鼠抗人Twist 及1:2000倍的鼠抗人β-actin抗体作为内参,4℃环境下过夜,TBST缓冲液漂洗5 min,共漂洗4次,TBST 缓冲液按1:1000稀释辣根过氧化物酶HRP标记的羊抗兔或羊抗鼠IgG二抗,37℃孵育60min,洗涤后ECL显色并拍照;
其中,所述CCK-8方法检测干扰Ang-2基因前后的肺癌细胞增殖能力的具体步骤:
设置实验组:shRNA实验组,阴性对照组和空白对照组,在96孔板中接种对数生长期A549细胞,每孔2000个,每孔100µl;
24小时后进行细胞转染,以CCK8实验,分别检测转染后0h、24h、48h、72h细胞增殖情况,每个时段设置3个复孔;
每孔加入10µl CCK8溶液继续培养120min,用多功能酶标仪在450nm波长测量各孔的吸光度A450值,取其均值。
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