[发明专利]一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物及其方法有效
申请号: | 201611174200.4 | 申请日: | 2016-12-19 |
公开(公告)号: | CN107058611B | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 李凡;李月月;谭冠林;肖龙;马龑;熊锋;兰平秀;陈小姣;何英云;谭松涛 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12R1/94 |
代理公司: | 11453 北京名华博信知识产权代理有限公司 | 代理人: | 李中强 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟草花叶病毒 通用检测 引物 病毒 扩增效果 保守区序列 病毒基因组 分子生物学 反向引物 检测引物 正向引物 对引物 灵敏度 检测 验证 | ||
本发明属于分子生物学和病毒学技术领域,具体涉及一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物及其方法;所述的烟草花叶病毒属病毒通用检测引物对序列为:正向引物TobamodF:5’‑TKGAYGGNGTBCCNGGNTGYGG‑3’,反向引物TobamodR:5’‑ACNGAVTBNABCTGTAATTGCTAT‑3’;本发明中的检测引物是基于烟草花叶病毒属中的32种病毒基因组保守区序列进行设计,用该属中的7种病毒对该对引物进行扩增效果验证,扩增效果均较好;从而建立了一种能够检测至少7种烟草花叶病毒属病毒的通用检测引物及方法,且具有检测效率高、灵敏度高、成本低的特点。
技术领域
本发明属于分子生物学和病毒学技术领域,具体涉及一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物及其方法。
背景技术
烟草花叶病毒属(Tobamovirus)是帚状病毒科(Virgaviridae)中病毒种类最多的一个属,根据2012年发布的国际病毒分类委员会(ICTV)第九次大会报告,Tobamovirus有25个确定种和6个暂定种,其代表种为TMV。而根据ICTV最新的在线报告显示,Tobamovirus已有35种病毒(http://www.ictvonline.org/virusTaxonomy.asp)。烟草花叶病毒属病毒在世界各地均有分布,能侵染茄科、十字花科、葫芦科等重要作物并引起严重危害,是最具经济重要性的病毒属之一。
目前为止,植物病毒中已有Potyvirus、Begomovirus、Luteovirus等病毒属的通用检测引物,大大提高了这些病毒的检测效率。烟草花叶病毒属病毒种类多且侵染性强,尤其是在茄科作物上发病严重,但迄今没有该属病毒的通用检测引物,用单一的特异性检测引物检测疑似病毒的侵染,工作量大、成本高且繁琐。为此,建立烟草花叶病毒属病毒(tobamoviruses)快速、简便、灵敏的检测技术很有必要,将对调查分析tobamoviruses的发生、分布,为烟草花叶病毒属病毒种类的鉴定以及病害防控等提供技术支撑。
发明内容
为了克服背景技术中存在的不足,本发明提出一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物及其方法,本发明检测方法简单,检测结果快速,灵敏度高。
本发明是通过如下技术方案实现的:
一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物序列为:
正向引物TobamodF:5’-TKGAYGGNGTBCCNGGNTGYGG-3’,
反向引物TobamodR:5’-ACNGAVTBNABCTGTAATTGCTAT-3’;
进一步,所述引物对TMGMV扩增出871bp的产物,对PMMoV扩增出877bp的产物,对TMV、ToMV、ToMMV扩增出880bp的产物,对ORSV扩增出889bp的产物,对CGMMV扩增出874bp的产物。
进一步,所述引物中N可以是A、C、G、T四种碱基中的任意一种,K为G和T中的一种,Y为C和T中的一种,B为C、G、T中的一种,V为A、C、G中的一种。
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