[发明专利]一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物及其方法有效
申请号: | 201611174200.4 | 申请日: | 2016-12-19 |
公开(公告)号: | CN107058611B | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 李凡;李月月;谭冠林;肖龙;马龑;熊锋;兰平秀;陈小姣;何英云;谭松涛 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12R1/94 |
代理公司: | 11453 北京名华博信知识产权代理有限公司 | 代理人: | 李中强 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟草花叶病毒 通用检测 引物 病毒 扩增效果 保守区序列 病毒基因组 分子生物学 反向引物 检测引物 正向引物 对引物 灵敏度 检测 验证 | ||
1.一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物,其特征在于:所述的烟草花叶病毒属病毒通用检测引物为:
正向引物TobamodF:5’-TKGAYGGNGTBCCNGGNTGYGG-3’,
反向引物TobamodR:5’-ACNGAVTBNABCTGTAATTGCTAT-3’;
所述的检测引物中N可以是A、C、G、T四种碱基中的任意一种,K为G和T中的一种,Y为C和T中的一种,B为C、G、T中的一种,V为A、C、G中的一种。
2.根据权利要求1所述的一种烟草花叶病毒属病毒通用检测引物,其特征在于:所述检测引物对TMGMV扩增出871bp的产物,对PMMoV扩增出877bp的产物,对TMV、ToMV、ToMMV扩增出880bp的产物,对ORSV扩增出889bp的产物,对CGMMV扩增出874bp的产物。
3.一种烟草花叶病毒属病毒通用检测方法,其特征在于:利用权利要求1所述的烟草花叶病毒属病毒通用检测引物进行检测,包括以下具体步骤:
RT反应体系:反转录试剂盒为PrimeScript 1st strand cDNA Synthesis Kit或 TaKaRa Reverse Transcriptase M-MLV RNase H- Kit,反应体系的总体积为10μL;PrimeScript 1st strand cDNA Synthesis Kit具体方法为,将含1-2μL的模板,0.5μL烟草花叶病毒属病毒通用检测引物反向引物,0.5μL 10mmol/L的dNTP mix,2-3μL ddH2O的混合液,混匀后65℃反应5min,反应结束迅速放冰上冷却,之后加入含2μL的5×Primer Script Buffer,0.25μL 40U/μL的RNase Inhibitor,0.5μL 200U/μL的Primer Script RTase,2.25μL ddH2O的混合液,之后45℃反应1h,70℃反应15min终止反应;
TaKaRa Reverse Transcriptase M-MLV RNase H- Kit的具体方法为,将含2μL模板,1μL烟草花叶病毒属病毒通用检测引物反向引物,3μL ddH2O的混合样混匀后,70℃下反应10min,迅速拿出放在冰上冷却3min,之后加入含2μL 5×M-MLV Buffer,0.5μL 10mM的dNTPmix,0.5μL RTase M-MLV,1μL ddH2O的混合液,在42℃反应1h,70℃下15min反应结束;
PCR反应体系:PCR扩增试剂盒为2×Es Taq MasterMix,反应体系的总体积为10μL,含5μL 2×Es Taq MasterMix,1μL cDNA模板,0.2-0.4μL烟草花叶病毒属病毒通用检测引物正向引物,0.2-0.4μL烟草花叶病毒属通用引物反向引物, 3.2-3.6μL ddH2O;
反应程序:94℃预变性2min;94℃变性30s,45-55℃退火30s,72℃延伸0.5-1min,循环30-35次;72℃延伸5-10min;4℃终止反应;
反应产物经1%琼脂糖凝胶电泳后在紫外灯下观察结果。
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