[发明专利]一种齐口裂腹鱼cGnRH Ⅱ基因克隆的方法在审
申请号: | 201410040443.3 | 申请日: | 2014-01-25 |
公开(公告)号: | CN103805596A | 公开(公告)日: | 2014-05-21 |
发明(设计)人: | 杨世勇;王韬;李志琼 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 625014*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 齐口裂腹鱼 cgnrh 基因 克隆 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种齐口裂腹鱼cGnRH II基因克隆的方法,属于基因克隆技术领域。
背景技术
促性腺激素释放激素(gonadotropin-releasing hormone,GnRH),又称促黄体素释放激素(1uteini-zing hormone-releasing hormone,LHRH),是由下丘脑分泌的十肽激素,是动物生殖过程中最重要的激素之一。GnRH脉冲式释放刺激垂体促性腺激素(GTH)的合成和分泌从而调节性激素的分泌,是性腺轴系的原动力,对性腺还可能具有直接作用。GnRH已被证明是下丘脑一垂体一性腺轴(hypothalamus-pituitary-gonadalaxis,HPG)的关键信号分子。GnRH家族中最保守的是chicken GnRH II(chicken-II-type Gonadotropin-releasing hormone,cGnRH II),它随同其他分子形式的GnRH共同存在于大多数脊椎动物中,存在于所有的有颌类包括人类中。
近年来,随着PCR技术的快速兴起和成熟,cDNA末端快速扩增技术(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)为简洁方便的基因克隆发展道路指出了新的方向。RACE是利用PCR技术由已知的部分cDNA序列来获得完整cDNA末端的方法,又称为锚定或单边PCR,一般有两种RACE方法,分别用于扩增3′端或5′端。5′RACE比3′RACE更具有挑战性,其特异性较低,产物可能是单一产物、多个产物,甚至是不能分辨的连续条带。最终质量取决于扩增所使用锚定引物的特异性、目的mRNA5端结构的复杂度和丰度及产物的长度等因素。可利用巢式引物扩增(最多进行三轮巢式扩增),增加逆转录保温温度和PCR退火温度,降低扩增反应中的镁离子浓度等方法增加5′RACE的特异性。SMART反转录酶法RACE技术比较而言是中最为成熟的。但是对于不同的试验对象仍然需要一定的改进。DTT是一种蛋白质保护剂,此外还有解开mRNA链5′端高级结构的作用。RACE技术的成功应用已经显示出它是一种高效简便的技术手段。它除了在获得全长cDNA序列方面的应用外,随着生物学各项技术的交叉利用,对RACE技术的改良和发展,伴随着优化条件下PCR扩增效率和忠实度的提高以及PCR产物克隆技术的进步,相信RACE技术在基因克隆以及RNA剪接、基因家族和基因表达变化等多项领域。
目前,所采用的技术有:RT-PCR克隆:是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)以及分子克隆相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的基因片段,将合成的目的基因片段克隆到载体细胞基因 中,然后用质粒PCR产物测序。该技术缺点在于:克隆未知基因的方法比如通过筛选文库等有个共同的弊病,即实验操作繁琐,周期较长、工作量繁重,且不易得到全长cDNA序列。另外,也有采用分段PCR克隆法:将目的基因分成几段来分别克隆,然后做亚克隆测序拼接。成本高,工作量大耗时,一个基因分成几段就需要做几次克隆,然后再做序列接拼。该技术缺点为:克隆未知基因的方法比如通过筛选文库等有个共同的弊病,即实验操作繁琐,周期较长、工作量繁重,且不易得到全长cDNA序列。
发明内容
本发明的目的在于提供一种高效、方便的获取齐口裂腹鱼chicken GnRH II基因的全长序列的方法,填补了该基因在齐口裂腹鱼上的空白,为进一步研究齐口裂腹鱼的该基因奠定了基础。
为了实现上述目的,本发明的技术方案如下。
一种齐口裂腹鱼cGnRH II基因克隆的方法,具体包括以下步骤:
(1)脑组织RNA的提取:总RNA提取采用TaKaRa试剂,具体步骤如下:
(1a)从-80℃冰箱中取出冻存组织,取100mg左右,放入高温灭菌处理过的研钵中,加入液氮,磨成粉末;
(1b)向1.5ml离心管于加入1ml预冷的Trizol裂解液,迅速把组织粉末放置于离心管中,剧烈振荡5min,使其充分溶解;
(1c)4℃条件下12000rpm离心10min,然后吸取上清的Trizol裂解液至新的1.5ml离心管中,冰上放置5分钟;
(1d)吸取0.2ml氯仿加入离心管中,激烈振荡15s,室温静置5min,4℃条件下13000rpm离心10min,将上层水相转移至新的EP管中;
(1e)加入0.5ml异丙醇,颠倒数次混匀,冰上沉淀10分钟;
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