[发明专利]一个基于双向长短时记忆和卷积神经网络的赖氨酸琥珀酰化修饰预测方法在审

专利信息
申请号: 202011609315.8 申请日: 2020-12-30
公开(公告)号: CN112927754A 公开(公告)日: 2021-06-08
发明(设计)人: 黄国华;张桂阳;王攀 申请(专利权)人: 邵阳学院
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 422000 湖南省邵阳*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种基于双向长短时记忆和卷积神经网络的赖氨酸琥珀酰化修饰预测方法,包括:将琥珀酰化蛋白序列分割以赖氨酸为中心,上下游各15个氨基酸残基的片段,用随机抽样方法处理数据的平衡问题;把已知的赖氨酸琥珀酰化修饰数据送入深度学习分类模型的嵌入层,把氨基酸转换成矢量表示,然后输入到一维卷积层、池化层、双向长短时记忆网络层、丢弃层、扁平层和全连接层,最终输出赖氨酸琥珀酰化修饰位点的信息;本发明吸收了隐藏在琥珀酰化序列中的语义关系,能够快速有效地预测赖氨酸琥珀酰化修饰;本发明还开发了网络预测平台,用于对赖氨酸琥珀酰化修饰位点的在线预测。
搜索关键词: 一个 基于 双向 短时记忆 卷积 神经网络 赖氨酸 琥珀 修饰 预测 方法
【主权项】:
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