[发明专利]一种基于三维组学数据的西藏特色鱼类基因组组装方法有效
| 申请号： | 202010399433.4 | 申请日： | 2020-05-12 |
| 公开（公告）号： | CN111584004B | 公开（公告）日： | 2023-06-27 |
| 发明（设计）人： | 刘海平;牟振波;肖世俊 | 申请（专利权）人： | 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20;G16B30/10 |
| 代理公司： | 武汉天领众智专利代理事务所(普通合伙) 42300 | 代理人： | 杨建军 |
| 地址： | 850000 西藏自*** | 国省代码： | 西藏;54 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于三维组学数据的西藏特色鱼类基因组组装方法，该方法将西藏特色鱼类待测样本的Hi‑C测序数据比对到该待测样本初步基因组contig序列中获得contig序列之间的位置关系，然后填补contig序列之间的空缺获得高质量的西藏特色鱼类基因组编码信息。因此，本发明的方法显著提高了组装结果中contig水平的连续性，从而提升特色西藏鱼类复杂基因组组装的质量。同时，本发明的组装方法获得连续性更好的参考基因组，为后续进行大规模基因组上的基因进化和功能研究提供保障，也更有利于西藏和其他地区鱼类的相关功能基因的QTL定位和GWAS研究，以及相关的群体遗传多样性和群体结构研究。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 三维 数据 西藏 特色 鱼类 基因组 组装 方法 | ||
【主权项】：
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