[发明专利]基于改进XGBoost的泛癌症基因通路预测方法、系统和存储介质在审

专利信息
申请号: 202010041366.9 申请日: 2020-01-15
公开(公告)号: CN111243662A 公开(公告)日: 2020-06-05
发明(设计)人: 阿丽玛;刘朝锐;张玉;周维 申请(专利权)人: 云南大学
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B20/50;G16B40/20
代理公司: 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 代理人: 阳佑虹
地址: 650091 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要: 发明公开了一种基于改进XGBoost的泛癌症基因通路预测方法、系统和存储介质,该方法利用训练数据集对改进XGBoost模型进行训练,至模型收敛;其中,改进的XGBoost模型为在XGBoost模型基础上,增加了阈值选择流程,阈值用于控制正负样本的分类边界,阈值选择流程根据分类指标对阈值进行调整。本发明以树形结构XGBoost为基础,通过分裂节点选取的方式,解决了生物数据连续值中异常值的问题,同时解决因数据预处理带来的数据分类边界偏移的问题;支持交叉验证,可通过提前停止来获得最优的训练效果。创新的改进XGBoost,增加阈值控制,解决因类别数据样本不平衡带来的权重偏移问题,提升预测的AUROC和AUPR值,使分类效果达到更优。
搜索关键词: 基于 改进 xgboost 癌症 基因 通路 预测 方法 系统 存储 介质
【主权项】:
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