[发明专利]一种基于评分机制与LightGBM的CircRNA功能预测方法在审

专利信息
申请号: 201910246871.4 申请日: 2019-09-17
公开(公告)号: CN112530520A 公开(公告)日: 2021-03-19
发明(设计)人: 邓怡云;王高平;戴宪华 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30;G16B30/00;G16B40/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 为克服现有技术的不足,本发明的目的在于利用评分机制结合LightGBM方法对circRNA的功能进行预测。本发明为解决其问题所采用的技术方案主要步骤是:(1)将大数据样本的circRNA以(.bed)文件形式输入。(2)将circRNA(.bed)文件映射到全人类基因组(hg19版本)上,得到circRNA序列信息(.fasta)文件。(3)提出了一种特征融合算法,对CircRNA特征进行融合。(4)将特征输入至A类判决系统,将编码蛋白型circRNA区分出来。(5)其它CircRNA分别经过三个模型,依照顺序判别CircRNA各项功能,得到预测概率值。(6)根据评分机制,将上述所得到的三个预测概率值,通过B类判决系统,得到最终的circRNA功能分类预测结果。
搜索关键词: 一种 基于 评分 机制 lightgbm circrna 功能 预测 方法
【主权项】:
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