[发明专利]用于鉴定多个基因组编辑和预测鉴定的基因组编辑的集总效应的系统和方法在审
| 申请号： | 201880023237.8 | 申请日： | 2018-03-29 |
| 公开（公告）号： | CN110476214A | 公开（公告）日： | 2019-11-19 |
| 发明（设计）人： | D.V.布特勒伊尔;L.E.弗拉格尔 | 申请（专利权）人： | 孟山都技术有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;C12N15/79;A01K67/027 |
| 代理公司： | 72001 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人： | 徐晶;黄希贵<国际申请>=PCT/US2 |
| 地址： | 美国密*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 公开了用于从候选编辑群体中进行选择并预测所述候选编辑的集总效应的示例性系统和方法。一种示例性方法包括鉴定所述生物体的基因组序列的候选编辑群体，以及基于预测的每个候选编辑影响所述生物体中感兴趣的性状的能力来对所述候选编辑中的每个候选编辑进行排名。所述示例性方法还包括基于所述排名选择所述候选编辑中的一个或多个候选编辑，以及由所述计算装置预测当所述感兴趣的性状由具有基因组序列的所述生物体的试样表达并根据所述候选编辑中的所述选择的一个或多个候选编辑进行编辑时，与所述生物体的未编辑试样相比，所述候选编辑中的所述选择的一个或多个候选编辑对所述感兴趣的性状的集总效应。 | ||
| 搜索关键词： | 生物体 性状 基因组序列 集总效应 预测 计算装置 群体 | ||
【主权项】：
1.一种用于预测生物体中多个基因组编辑的表型影响的方法，所述方法包括：/n基于基因组注释、全基因组关联研究(GWAS)分析、基因表达数据和生化途径模型中的至少一者，鉴定所述生物体的基因组序列的候选编辑群体；/n由计算装置基于预测的每个候选编辑影响所述生物体中的一种或多种感兴趣的性状的能力来对所述候选编辑中的每个候选编辑进行排名，所述预测的能力为基于引起效应的概率、所述效应的大小和非参数分类参数中的至少一者；/n由所述计算装置基于所述排名来选择所述候选编辑中的多个候选编辑；以及/n由所述计算装置预测当所述一种或多种感兴趣的性状由具有基因组序列的所述生物体的试样表达并根据所述候选编辑中的所述选择的多个候选编辑进行编辑时，与所述生物体的未编辑试样相比，所述候选编辑中的所述选择的多个候选编辑对所述一种或多种感兴趣的性状的集总效应。/n
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