[发明专利]鼠伤寒沙门氏菌的分子分型方法和特异SNP位点组合有效
| 申请号： | 201811636884.4 | 申请日： | 2018-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN109486975B | 公开（公告）日： | 2022-02-25 |
| 发明（设计）人： | 李绮雯;林德春;李力强 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/689 | 分类号： | C12Q1/689;C12Q1/10;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;白艳 |
| 地址： | 518083 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了鼠伤寒沙门氏菌的分子分型方法和特异SNP位点组合。本发明提供了检测待测鼠伤寒沙门氏菌的基因组中16个SNP位点核苷酸的物质在制备检测或辅助检测鼠伤寒沙门氏菌分子分型情况产品中的应用；或，检测待测鼠伤寒沙门氏菌的基因组中16个SNP位点核苷酸的物质在对待测鼠伤寒沙门氏菌进行分子分型中的应用；本发明的实验证明，本发明针对临床常见的血清型鼠伤寒沙门氏菌，研发样本量超过6000株，进行分子分型，得到用于分子分型的SNP位点集合，用该集合可以设计相应探针，在实验上对鼠伤寒沙门氏菌进行快速分型，时间短，耗材低；另外，鼠伤寒沙门genotyping难度大于伤寒沙门氏菌，因此，研发出一套针对鼠伤寒沙门的分子分型技术极具价值。 | ||
| 搜索关键词： | 伤寒 沙门氏菌 分子 方法 特异 snp 组合 | ||
【主权项】：
1.检测待测鼠伤寒沙门氏菌的基因组中16个SNP位点核苷酸的物质在制备检测或辅助检测鼠伤寒沙门氏菌分子分型情况产品中的应用；或，检测待测鼠伤寒沙门氏菌的基因组中16个SNP位点核苷酸的物质在对待测鼠伤寒沙门氏菌进行分子分型中的应用；所述16个SNP位点为如下：76338位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体76338物理位置的SNP位点；114468位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体114468物理位置的SNP位点；845276位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体845276物理位置的SNP位点；207875位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体207875物理位置的SNP位点；719622位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体719622物理位置的SNP位点；178930位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体178930物理位置的SNP位点；525595位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体525595物理位置的SNP位点G；302985位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体302985物理位置的SNP位点C；111877位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体111877物理位置的SNP位点；151916位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体151916物理位置的SNP位点；165413位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体165413物理位置的SNP位点；668906位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体668906物理位置的SNP位点；153823位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体153823物理位置的SNP位点；276334位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体276334物理位置的SNP位点；99426位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体99426物理位置的SNP位点；24555位点，该位点为鼠伤寒沙门氏菌NC_016810.1染色体24555物理位置的SNP位点。
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