[发明专利]药效团聚类方法在审
| 申请号： | 201811561630.0 | 申请日： | 2018-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN109727636A | 公开（公告）日： | 2019-05-07 |
| 发明（设计）人： | 周凌霄;王曼 | 申请（专利权）人： | 周凌霄 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00;G16C20/50 |
| 代理公司： | 上海邦德专利代理事务所(普通合伙) 31312 | 代理人： | 余昌昊 |
| 地址： | 200341 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提出一种实现蛋白质与蛋白质，小分子与蛋白质之间结合的药效团聚类方法，包括步骤：步骤一、自动批量生成药效团模型；步骤二、从药效团模型中提取每个药效团特征的3D坐标和特征名称；步骤三、计算提取的每个药效团特征的部分电荷与疏水性，利用部分电荷与疏水性重新定义每个药效团特征；步骤四、将每个药效团特征置于五维空间；步骤五：计算出药效团模型间的差异值；步骤六：对批量的药效团模型进行聚类，聚类结果用于预测蛋白质与蛋白质或蛋白质与小分子化合物间的结合。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质 药效团模型 药效团特征 电荷 疏水性 团聚 小分子化合物 聚类结果 重新定义 小分子 聚类 五维 预测 | ||
【主权项】：
1.一种药效团聚类方法，其特征在于，包括步骤：步骤一、自动批量生成药效团模型；步骤二、从所述药效团模型中提取每个药效团特征的3D坐标和特征名称；步骤三、计算提取的每个所述药效团特征的部分电荷与疏水性，利用所述部分电荷与疏水性重新定义每个药效团特征；步骤四、将每个所述药效团特征置于五维空间；步骤五：计算出药效团模型间的差异值；步骤六：对批量的所述药效团模型进行聚类，聚类结果用于预测蛋白质与蛋白质或蛋白质与小分子化合物间的结合。
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