[发明专利]一种基因组单倍体组装方法及装置有效
申请号: | 201811069322.6 | 申请日: | 2018-09-13 |
公开(公告)号: | CN109273052B | 公开(公告)日: | 2022-03-18 |
发明(设计)人: | 郑洪坤;邓德晶;刘敏;李绪明;黎松;刘福;刘东源 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王莹;李相雨 |
地址: | 101300 北京市顺义区南*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明实施例提供一种基因组单倍体组装方法及装置,所述方法包括:获取参考基因组的SNP信息;分别采用PacBio数据和Hi‑C数据获取所述SNP信息的定相信息;根据所述定相信息获取全基因组的整合定相信息;根据所述整合定相信息区分所述PacBio数据的测序片段的单倍体来源,并分别进行基因组单倍体组装。所述装置执行上述方法。本发明实施例提供的基因组单倍体组装方法及装置,通过整合定相信息区分PacBio数据的测序片段的单倍体来源,并分别进行基因组单倍体组装,能够实现全基因组的单倍体组装,并提高组装出的基因组序列的精细程度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因组 单倍体 组装 方法 装置 | ||
【主权项】:
1.一种基因组单倍体组装方法,其特征在于,包括:获取参考基因组的SNP信息;分别采用PacBio数据和Hi‑C数据获取所述SNP信息的定相信息;根据所述定相信息获取全基因组的整合定相信息;根据所述整合定相信息区分所述PacBio数据的测序片段的单倍体来源,并分别进行基因组单倍体组装。
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