[发明专利]动态搜索变异基因的方法、装置及计算机可读存储介质

摘要

本发明涉及基因筛选技术领域，具体涉及一种动态搜索变异基因的方法、装置及计算机可读存储介质，该方法包括获取若干个病人基因数据集；统计各个基因是否存在变异情况；计算各个基因的已变异频率；筛选已变异频率最高的基因添加到变异基因列表中，删除该基因以及包含该基因已变异情况的病人基因数据集；计算剩下的各个基因在剩下的病人基因数据集中的已变异频率，再次进行筛选直到若干个病人基因数据集删除完毕，则输出变异基因列表。本方法搜索变异基因的效率很高，平均只保留原数据库中约3.5％的总体变异基因，且具有最大的病人覆盖率因此具有很高的代表性，筛选出的基因具有显著临床意义，不但能够指导疾病诊断，还能够作为疾病治疗靶点。

主权项

1.一种动态搜索变异基因的方法，其特征在于，所述方法包括：S1：获取某种疾病类型的若干个病人基因数据集；S2：统计各个所述病人基因数据集中的各个基因是否存在变异情况；其中，构建一个行数等于基因总个数，列数等于病人基因数据集总个数的矩阵，每一行代表一个基因在各个病人基因数据集中的变异情况，每一列代表一个病人基因数据集中各个基因的变异情况；依次判断各个病人基因数据集中的各个基因是否存在变异情况，若已变异，则将该病人基因数据集与该基因相交位置的矩阵值设为第一预设值，若未变异，则设为第二预设值；统计完所有的病人基因数据集中的各个基因是否存在变异情况后结束；S3：计算各个所述基因在所述若干个病人基因数据集中的已变异频率；其中，计算各个基因在若干个病人基因数据集中存在变异情况的变异总个数；将计算出的各个基因的变异总个数分别除以病人基因数据集的总个数获得各个基因在若干个病人基因数据集中的已变异频率；S4：筛选所述已变异频率最高的基因添加到变异基因列表中，删除该基因以及删除包含该基因已变异情况的病人基因数据集；其中，根据算出的各个基因的已变异频率，将所有基因按已变异频率降序排序；删除排名第一的基因行以及删除包含该基因已变异情况的病人基因数据集列；S5：判断所述若干个病人基因数据集是否删除完毕，若否，则计算剩下的各个基因在剩下的病人基因数据集中的已变异频率，返回S4；若是，则进入S6；S6：输出所述变异基因列表。