[发明专利]G蛋白偶联受体-配体相互作用关系的预测方法及预测系统在审
申请号: | 201810329690.3 | 申请日: | 2018-04-13 |
公开(公告)号: | CN108647487A | 公开(公告)日: | 2018-10-12 |
发明(设计)人: | 江振然;陶然;陈范曙 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16;G06F19/24 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 200062 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于多信息整合的G蛋白偶联受体(GPCR)‑配体相互作用的预测方法,其包括:构建非孤儿受体的G蛋白偶联受体‑配体相互作用网络结构图;将孤儿受体与非孤儿受体之间的受体‑受体关系嵌入到所述受体‑配体关系网络中,基于网络中节点之间的距离关系;构建受体‑配体作用对的特征关系,结合集成学习方法,实现了对受体‑配体潜在关系的有效预测。本发明方法针对GPCR及其配体的生物学特征,建立并实现适合G蛋白偶联受体‑配体相互作用关系的预测以及孤儿GPCR潜在配体的预测,实验表明该方法预测效果好,有较为广泛的应用前景。本发明还公开了一种基于多信息整合的G蛋白偶联受体(GPCR)‑配体相互作用的预测系统。 | ||
搜索关键词: | 配体相互作用 配体 预测 孤儿受体 信息整合 预测系统 构建 生物学特征 网络结构图 关系嵌入 关系网络 结合集成 距离关系 潜在关系 特征关系 与非 应用 网络 学习 | ||
【主权项】:
1.一种预测G蛋白偶联受体‑配体相互作用关系的方法,其特征在于,所述预测方法包括:步骤(1):构建非孤儿受体的G蛋白偶联受体‑配体相互作用网络结构图,以受体和配体作为网络中的节点,以受体‑配体关系作为网络中的边,将受体与配体之间的关系映射到受体‑配体关系相互作用网络中;步骤(2):将孤儿受体与非孤儿受体之间的受体‑受体关系嵌入到所述步骤(1)构建的上述受体‑配体关系相互作用网络中,基于网络节点之间的路径关系,构建受体‑配体作用对特征关系,然后结合不同分类器,实现对受体‑配体相互作用关系的预测以及对孤儿受体潜在配体的有效预测。
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