[发明专利]一种简单便捷检测SNP的新方法

摘要

本发明公开了一种简单便捷检测SNP的新方法。本发明提供了的引物组；引物组Ⅰ包括两条上游引物和一条下游引物；FX1引物和FY1引物的差别：3’末端第1位核苷酸，FX1引物对应特异SNP的X多态，FY1引物对应Y多态；FX1引物和FY1引物均为碱基错配引物；引物组Ⅱ包括两条上游引物和一条下游引物；FX2引物和FY2引物差异：3’末端第1位核苷酸不同，FX2引物对应特异SNP的X多态，FY2引物对应Y多态；FY2引物的5’端增加10‑20个随机核苷酸；FX2引物和FY2引物均为碱基错配引物。本发明提供的引物组可广泛应用于各类目标SNP位点的检测中，具有广阔的应用前景。

主权项

1.用于检测特异SNP位点基因型的引物组，为引物组Ⅰ或引物组Ⅱ；所述特异SNP的多态形式为X/Y多态；引物组Ⅰ包括两条上游引物和一条下游引物；将两条上游引物分别命名为FX1引物和FY1引物，将一条下游引物命名为R1引物；FX1引物和FY1引物的差别仅在于3’末端开始计的第1位核苷酸，FX1引物对应特异SNP的X多态，FY1引物对应特异SNP的Y多态；FX1引物和R1引物组成引物对甲，FY1引物和R1引物组成引物对乙；引物对甲和引物对乙的靶序列中均具有所述特异SNP位点；FX1引物和FY1引物均为单碱基错配引物或两碱基错配引物；所述单碱基错配引物中具有错配碱基的核苷酸为3’末端开始计的第2位核苷酸；所述两碱基错配引物中具有错配碱基的核苷酸位于3’末端开始计的第2位核苷酸和第3位核苷酸；引物组Ⅱ包括两条上游引物和一条下游引物；将两条上游引物分别命名为FX2引物和FY2引物，将一条下游引物命名为R2引物；FX2引物和FY2引物存在两个差异：①3’末端开始计的第1位核苷酸不同，FX2引物对应特异SNP的X多态，FY2引物对应特异SNP的Y多态；②与FX2引物相比，FY2引物的5’端增加10‑20个随机核苷酸；FX2引物和R2引物组成引物对丙，FY2引物和R2引物组成引物对丁；引物对丙和引物对丁的靶序列中均具有所述特异SNP位点；FX2引物和FY2引物均为单碱基错配引物或两碱基错配引物；所述单碱基错配引物中具有错配碱基的核苷酸为3’末端开始计的第2位核苷酸；所述两碱基错配引物中具有错配碱基的核苷酸位于3’末端开始计的第2位核苷酸和第3位核苷酸。