[发明专利]一种小黄鱼微卫星富集文库的构建方法在审
申请号: | 201711339116.8 | 申请日: | 2017-12-14 |
公开(公告)号: | CN108118051A | 公开(公告)日: | 2018-06-05 |
发明(设计)人: | 刘炳舰;吕振明;龚理;刘立芹;柳意樊 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316000 浙江省舟*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种小黄鱼微卫星富集文库的构建方法,包括酶切,接头溶液制备,接头连接,连接产物PCR扩增,磁珠富集,文库构建。有益效果为:本发明公开的构建方法简单高效,过程中DNA片段的损失少,成本低,为小黄鱼遗传多样性检测、种群遗传结构分析和亲权鉴定等研究提供了理想的DNA片段。 | ||
搜索关键词: | 构建 微卫星富集文库 遗传多样性 磁珠富集 接头连接 结构分析 连接产物 溶液制备 文库构建 种群遗传 酶切 检测 研究 | ||
【主权项】:
一种小黄鱼微卫星富集文库的构建方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:1)酶切:从小黄鱼肌肉或鳍条组织中提取基因组DNA,使用限制性内切酶RsaI对小黄鱼基因组DNA进行酶切;2)接头溶液制备:将接头SuperSNX24 Forward:5’GTTTAAGGCCTAGCTAGCAGAATC和接头SuperSNX24+4P Reverse:5’pGATTCTGCTAGCTAGGCCTTAAACAAAA分别制成10μM的水溶液,等体积混合,得接头溶液;3)接头连接:将酶切片段与接头溶液混合,得连接产物;4)连接产物PCR扩增:以连接产物为模板,进行PCR反应;5)磁珠富集:将连接产物的PCR扩增产物与生物素探针杂交,接着将杂交产物与包被有链霉素的磁珠混合,接着洗脱磁珠表面的富集片段,以洗脱片段为模板进行PCR扩增反应;6)文库构建:将洗脱片段的PCR扩增产物与克隆载体相连接,然后转入大肠杆菌感受态细胞,构建小黄鱼微卫星富集片段的克隆文库。
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