[发明专利]基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法和装置有效
| 申请号： | 201711276870.1 | 申请日： | 2017-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN108021788B | 公开（公告）日： | 2022-08-05 |
| 发明（设计）人： | 万季;宋麒;潘有东;崔好;韩艳;高峰 | 申请（专利权）人： | 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/50;G16B40/20;G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京金信知识产权代理有限公司 11225 | 代理人： | 黄威;范琏 |
| 地址： | 102206 北京市昌*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 提供一种基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法和装置。方法包括由处理器执行的如下步骤：获取不同类别的样本的细胞游离DNA的深度测序数据；计算每个样本数据在每个碱基位置的各变异的频率值；基于所计算的每个碱基位置的各变异的频率值，得到每个类别在所有碱基位置上的变异的频率分布；确定频率分布在类别间具有充分差异的变异；以及基于所确定的变异提取所述生物标记物。该方法可以极大限度地挖掘cfDNA数据中的信息。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 细胞 游离 dna 深度 序数 提取 生物 标记 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法，所述方法由计算机实现，包括由处理器执行的如下步骤：获取不同类别的样本的细胞游离DNA的深度测序数据；计算每个样本数据在每个碱基位置的各变异的频率值；基于所计算的每个碱基位置的各变异的频率值，得到每个类别在碱基位置上的变异的频率分布；确定频率分布在类别间具有充分差异的变异；以及基于所确定的变异提取所述生物标记物。
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