[发明专利]预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备有效

专利信息
申请号: 201711271142.1 申请日: 2017-12-05
公开(公告)号: CN107977548B 公开(公告)日: 2020-04-07
发明(设计)人: 汤一凡;崔朝辉;赵立军;张霞 申请(专利权)人: 东软集团股份有限公司
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B30/10
代理公司: 北京英创嘉友知识产权代理事务所(普通合伙) 11447 代理人: 魏嘉熹;南毅宁
地址: 110179 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 本公开涉及一种预测蛋白质间相互作用的方法、装置、介质及电子设备。方法包括:获取待预测的目标蛋白质序列对,其包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列;确定第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列各自的同源蛋白质序列;将两个目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合,获得至少一个同源蛋白质序列对;根据至少一个同源蛋白质序列对,在已知蛋白质序列对中进行检索;若在已知蛋白质序列对中检索到预定数量的同源蛋白质序列对时,预测第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。由此,可实现蛋白质间相互作用的快速、准确地预测,为生物研究人员进行生物实验提供较为可靠的数据支持。
搜索关键词: 预测 蛋白质 相互作用 方法 装置 介质 电子设备
【主权项】:
一种预测蛋白质间相互作用的方法,其特征在于,所述方法包括:获取待预测的目标蛋白质序列对,所述目标蛋白质序列对包括第一目标蛋白质序列和第二目标蛋白质序列;确定所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列;将所述第一目标蛋白质序列的同源蛋白质序列与所述第二目标蛋白质序列的同源蛋白质序列两两进行组合,获得至少一个同源蛋白质序列对;根据所述至少一个同源蛋白质序列对,在已知蛋白质序列对中进行检索,其中,每个所述已知蛋白质序列对中的两个蛋白质序列被认证具有相互作用;若在所述已知蛋白质序列对中检索到预定数量的所述同源蛋白质序列对时,预测所述第一目标蛋白质序列和所述第二目标蛋白质序列之间具有相互作用。
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