[发明专利]一种解析植物内生细菌菌群的方法有效
| 申请号： | 201711057190.0 | 申请日： | 2017-11-01 |
| 公开（公告）号： | CN109750113B | 公开（公告）日： | 2020-07-14 |
| 发明（设计）人： | 张莉莉;陈丽莹 | 申请（专利权）人： | 中国科学院微生物研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/689 | 分类号： | C12Q1/689;C12Q1/6869;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;白艳 |
| 地址： | 100101 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种解析植物内生细菌菌群的方法。本发明提供了用于解析植物内生细菌菌群的引物对，其靶序列为细菌16SrDNA的V3‑V4区的全长或部分；且所述引物对中的一条引物3’末端最后一个碱基与植物线粒体18SrDNA有差异，且该引物全长与植物线粒体18SrDNA的差异位点大于等于3个；另一条引物3’末端最后一个碱基与植物叶绿体16S rDNA有差异，且该引物全长与植物线粒体18SrDNA的差异位点大于等于3个。本发明设计了一对引物322F‑1和796R，选择了具有热启动活性且没有3’→5’外切酶校正活性的DNA聚合酶，共同实现了同时避开宿主植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA两种序列污染的目的，从而获得了纯的细菌菌群16S扩增子文库。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 解析 植物 细菌 方法 | ||
【主权项】：
1.用于解析植物内生细菌菌群的引物对，其靶序列为细菌16S rDNA的V3‑V4区的全长或部分；且所述引物对中的一条引物与植物线粒体18S rDNA中区域甲对应，且该引物3’末端最后一个碱基与所述区域甲中最后一个碱基有差异，且该引物与所述区域甲的差异位点大于等于3个；所述区域甲与所述一条引物的区别在于除了差异位点外其余碱基均相同或互补；所述引物对中的另一条引物与植物叶绿体16S rDNA中区域乙对应，且该引物3’末端最后一个碱基与所述区域乙中最后一个碱基有差异，且该引物与所述区域乙的差异位点大于等于3个；所述区域乙与所述另一条引物的区别在于除了差异位点外其余碱基均互补或相同。
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