[发明专利]高通量微生物功能基因微阵列处理方法及电子设备有效
申请号: | 201711046082.3 | 申请日: | 2017-10-31 |
公开(公告)号: | CN107808073B | 公开(公告)日: | 2018-11-13 |
发明(设计)人: | 石舟;周集中;杨云锋;束文圣;邓晔;叶脉 | 申请(专利权)人: | 广东美格基因科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开一种高通量微生物功能基因微阵列处理方法及电子设备,方法包括:根据所选功能基因探针的数目,选择包括所选功能基因探针的数目的最小的预设规格作为当前规格,获取当前规格的微阵列中多个探针的信号值,所述微阵列划分为多个子阵列,每个子阵列的探针包括基因探针、以及多种类型的控制探针,所述控制探针至少包括:背景值控制探针、阳性控制探针、阴性控制探针和全局控制探针;对所获取的信号值进行去背景值处理、去噪声处理和标准化处理。本发明能够自动构建微阵列并进行信号预处理,从而有效应对由于现实中高通量微阵列杂交实验所受到各种环境因素以及人为操作的干扰,并且尽可能准确地获取所覆盖的目标功能基因的信号值。 | ||
搜索关键词: | 通量 微生物 功能 基因 阵列 处理 方法 电子设备 | ||
【主权项】:
1.一种高通量微生物功能基因微阵列处理方法,其特征在于,包括:根据所选功能基因探针的数目,选择包括所选功能基因探针的数目的最小的预设规格作为当前规格,获取当前规格的微阵列中多个探针的信号值,所述微阵列划分为多个子阵列,每个子阵列的探针包括基因探针、以及多种类型的控制探针,所述控制探针至少包括:背景值控制探针、阳性控制探针、阴性控制探针和全局控制探针;对所获取的信号值进行去背景值处理、去噪声处理和标准化处理。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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