[发明专利]基于US-ELM的基因芯片表达数据分析系统及方法有效
| 申请号： | 201710596384.1 | 申请日： | 2017-07-20 |
| 公开（公告）号： | CN107368707B | 公开（公告）日： | 2020-07-10 |
| 发明（设计）人： | 王之琼;李艳丽;曲璐渲;汪新蕾;赵亚楠 | 申请（专利权）人： | 东北大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G06N3/00 |
| 代理公司： | 沈阳优普达知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 21234 | 代理人： | 张志伟 |
| 地址： | 110819 辽宁*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明的基于US‑ELM的基因芯片表达数据分析系统及方法包括，基因预处理单元，用于对基因芯片进行预处理以获得适用于实验的数据格式；差异基因筛选单元，基于基因表达数据矩阵寻找在基因芯片中不同个体或者是不同组织中表达发生明显变化的差异基因，获得差异表达基因矩阵；聚类单元，用于对差异表达基因矩阵进行聚类分析，得到共表达基因序列；富集分析单元，用于对共表达基因序列进行富集分析，得到关于基因所参与的多条通路，得出在数据上共表达基因序列的生物学功能解释。本发明的分析系统及方法整体上提高了数据分析的准确性，差异基因处理过程筛选出更有效的明显表达差异基因，聚类处理中得出的类别在生物学解释上具有更多的相似性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 us elm 基因芯片 表达 数据 分析 系统 方法 | ||
【主权项】：
一种基于US‑ELM的基因芯片表达数据分析系统，其特征在于，包括：基因预处理单元，用于对基因芯片进行预处理以获得适用于实验的数据格式,即基因表达数据矩阵；差异基因筛选单元，基于基因表达数据矩阵寻找在基因芯片中不同个体或者是不同组织中表达发生明显变化的差异基因，获得差异表达基因矩阵；聚类单元，用于对差异表达基因矩阵进行聚类分析，得到共表达基因序列；富集分析单元，用于对共表达基因序列进行富集分析，得到关于基因所参与的多条通路，得出在数据上共表达基因序列的生物学功能解释。
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