[发明专利]一种建立云粳系列水稻品种DNA分子标签的方法

摘要

本发明公开一种建立云粳系列水稻品种DNA分子标签的方法。该方法提供6对鉴别云粳系列水稻品种的特异性引物，实现了以广泛基因组覆盖度的最少引物鉴定云粳系列水稻品种，能够用最少的引物构建所有云粳系列水稻品种的DNA分子标签，减少了繁复的工作量和高昂的检测成本，能够把云粳系列水稻品种与其它云南高原粳稻品种鉴别开，同时还可以把云粳系列水稻品种一一区分开。该方法将扩增获得的云粳系列水稻品种DNA指纹数据和采集的基本商品信息数字化编码赋值，形成二维码表述，获得云粳系列水稻品种DNA分子标签，达到品种识别及科学的种子管理的唯一性、可识别性、可追溯性，标识于商品种子包装上，用于水稻优良品种种子的防伪和溯源。

主权项

一种建立云粳系列水稻品种DNA分子标签的方法，包括(1)云粳系列水稻品种基因组DNA提取、(2)PCR扩增、(3)PCR产物的毛细管电泳荧光检测、(4)DNA指纹数据的获得、(5)云粳系列水稻品种基本商品信息数据的采集、(6)云粳系列水稻品种DNA分子标签制作步骤，其特征在于：在所述(2)PCR扩增中每一个云粳系列水稻品种提取的基因组DNA，分别用引物RM8277，RM551，RM190，RM336，RM219和RM432进行扩增，所述引物RM8277由RM8277正向引物和RM8277反向引物组成，所述的RM8277正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：1所示，RM8277反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：2所示；所述引物RM551由RM551正向引物和RM551反向引物组成，所述RM551正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：3所示，RM551反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：4所示；所述引物RM190由RM190正向引物和RM190反向引物组成，所述RM190正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：5所示，RM190反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：6所示；所述引物RM336由RM336正向引物和RM336反向引物组成，所述RM336正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：7所示，RM336反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：8所示；所述引物RM219由RM219正向引物和RM219反向引物组成，所述RM219正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：9所示，RM219反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：10所示；所述引物RM432由RM432正向引物和RM432反向引物组成，所述RM432正向引物的碱基序列如SEQ ID NO：11所示，RM432反向引物的碱基序列如SEQ ID NO：12所示；在所述(4)DNA指纹数据的获得中每一个云粳系列水稻品种的DNA指纹数据的获得是根据毛细管荧光电泳读出的该云粳系列水稻品种6个位点的等位变异片段大小数据，纯合位点的等位变异记录为X/X，以X/X的形式表示其DNA指纹数据，杂合位点的等位变异记录为X/Y，以X/Y的形式表示其DNA指纹数据，其中X、Y为该位点上两个不同的等位变异片段大小数据，小片段在前，大片段在后，以两个片段大小记录；每一个云粳系列水稻品种的DNA指纹数据X/Y或X/Y依次按引物RM8277、引物RM551、引物RM190、引物RM336、引物RM219、引顺RM432的引物顺序排列；在所述(5)云粳系列水稻品种基本商品信息数据的采集中每一个云粳系列水稻品种所采集的基本商品信息数据包括作物种类、品种植物学类型、品种繁殖类型、品种名称、单元识别代码、审定区域和审定的年份，所述的单元识别代码是用1、2、3……自然数中的任意数表示，且不同的云粳系列水稻品种的单元识别代码均不相同；所述(6)云粳系列水稻品种DNA分子标签制作是将同一云粳系列水稻品种在步骤(4)获得的DNA指纹数据和在步骤(5)所采集的基本商品信息数据输入二维码生成器生成二维码图形即为云粳系列水稻品种DNA分子标签。