[发明专利]多基因捕获测序的单链探针制备方法有效

专利信息
申请号: 201710397693.6 申请日: 2017-05-31
公开(公告)号: CN107236727B 公开(公告)日: 2021-09-14
发明(设计)人: 王弢;官民晓;巴兆粉;陆亚红 申请(专利权)人: 江苏为真生物医药技术股份有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6811
代理公司: 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 代理人: 赵荣之
地址: 215000 江苏省苏州市苏州工*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种多基因捕获测序的单链探针制备方法,该方法包括如下步骤:1、芯片合成,2、芯片DNA洗脱,3、用含dUTP的PCR反应体系扩增芯片DNA,4、PCR产物用磁珠纯化,5、使用单引物偏向扩增,该引物5’端经生物素标记,得到含有生物素单链与含有dUTP的链的杂合双链DNA,6、加入能够识别并切除dUTP的酶,将5步中的含有dUTP的母链消化,7、消化后产物经纯化,得到含有生物素标记的单链探针,8、稀释至所需浓度并进行分装保存。与市售合成的探针相比,酶法反应条件温和,成本降低,易于推广。
搜索关键词: 多基因 捕获 探针 制备 方法
【主权项】:
一种多基因捕获测序的单链探针制备方法,其特征在于:该方法至少包括如下步骤:(1)芯片合成,合成不同寡核苷酸的芯片,所述的芯片包含能够与靶序列结合的80bp‑120bp目标区域碱基,目标区域碱基两端分别连接15‑20bp碱基末端;(2)芯片DNA洗脱;(3)用含dUTP的PCR反应体系扩增芯片DNA,dUTP摩尔浓度范围为5μM‑750μM;(4)PCR产物用磁珠纯化;(5)将步骤(4)中纯化的PCR产物稀释,作为下一步PCR的模板,使用单引物偏向扩增,该引物5’端经生物素标记,得到含有生物素单链与含有dUTP的链的杂合双链DNA;(6)加入能够识别并切除dUTP的酶,将(5)步中的含有dUTP的母链消化;(7)消化后产物经纯化,得到含有生物素标记的单链探针;(8)对制备的单链探针进行电泳检测和浓度测定,得到每种单链探针物质的量为nmol级别,将质检合格的探针稀释保存。
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