[发明专利]一种基于长片段进行骨架组装的方法有效
| 申请号： | 201710304027.3 | 申请日： | 2017-05-03 |
| 公开（公告）号： | CN107273716B | 公开（公告）日： | 2020-04-28 |
| 发明（设计）人： | 邬三毛;郭文浒;肖世俊;陈楠生 | 申请（专利权）人： | 武汉菲沙基因信息有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人： | 杨立;朱毅 |
| 地址： | 430075 湖北省武汉市*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于长片段进行骨架组装的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：获得长片段序列数据和基因组拼接结果，得到基因组预估大小、基因组拼接大小以及拼接块数量；S2：根据所述长片段序列数据和基因组拼接结果估计mate pair之间的插入长度范围；S3：根据所述长片段序列数据和所述插入长度范围生成mate pair文库；S4：用S3得到的mate pair文库对所述基因组拼接结果进行骨架组装，得到骨架组装结果。通过使用本发明的方法，可在不需要进行额外的mate pair或pair end测序的情况下，直接利用已有的长片段序列来获得mate pair文库，从而完成接下来的骨架组装。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 片段 进行 骨架 组装 方法 | ||
【主权项】：
一种基于长片段进行骨架组装的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：获得长片段序列数据和基因组拼接结果，得到基因组预估大小、基因组拼接大小以及拼接块数量；S2：根据所述长片段序列数据和基因组拼接结果计算mate pair之间的插入长度范围；S3：根据所述长片段序列数据和所述插入长度范围生成mate pair文库；S4：用S3得到的mate pair文库对所述基因组拼接结果进行骨架组装，得到骨架。
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