[发明专利]一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法

摘要

本发明涉及生物技术领域，特别涉及一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。本发明中首先以标准的医疗样本采集流程收集冰冻的新鲜癌症组织样本，对选取目的基因共21个基因进行实时荧光定量PCR技术检测基因的表达量数值，根据这些数值以不同种类基因编好的运算公式进行风险值的计算，并进行评估。本发明能够提供一种更为精确的针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。

主权项

1.一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法，其特征在于，包括如下步骤：S1：样本采集以标准的医疗样本采集流程收集冰冻的新鲜癌症组织样本；S2：实时荧光定量PCR技术检测基因的表达量数值选取目的基因共21个基因，包括16个肿瘤相关基因和5个参考基因，其中肿瘤相关基因包括：HER2相关基因有GRB7、ERBB2，雌激素相关基因有ESR1、PGR、BCL2、SCUBE2，增殖相关基因有BIRC5、MKI67、CCNB1、MYBL2、AURKA，侵袭相关基因有MMP11、CTSL2，另外还包括GSTM1、CD68、BAG1，对所选目的基因按照操作手册依次进行cDNA合成和实时荧光定量PCR，获得21基因表达量数值；S3：风险值的计算首先对基因表达值标准化处理，使基因表达值在0到15之间，其计算公式为：genex＝(xi‑Mingene)*15/(Maxgene‑Mingene)genex表示标准化后到值，xi表示实验测出来的表达值，Mingene是此基因在已有患者中的最小表达值，Maxgene是此基因在已有患者中的最大表达值；根据上述步骤计算复发风险值，计算各组别算法如下：HER2分组值＝0.9*GRB7+0.1*HER2，如果结果小于8，把分值设为8；雌激素相关基因分值＝(0.8*ESR1+1.2*PGR+BCL2+SCUBE2)/4；增殖相关基因组分值＝(BIRC5+MKI67+MYBL2+CCNB1+AURKA)/5，如果结果小于6.5，把分值设为6.5；侵袭相关基因组分值＝(CTSL2+MMP11)/2，其中各基因名代表此基因表达量；未矫正的复发风险值设为RSU，由以下公式推导：RSU＝+0.47*HER2分组值‑0.34*雌激素相关基因分值+1.04*增殖相关基因组分值+0.10*侵袭相关基因组分值+0.05*CD68‑0.08GSTM1‑0.07*BAG1；矫正的复发风险值设为RS_R，由以下公式推导：如果RSU在0和100范围内，RS_R＝20*(RSU)；如果RSU小于0，RS_R＝0；如果RSU大于100，RS_R＝100；最终的复发风险值设为RS，由以下公式推导：如果RS_R小于18，RS＝0；如果RS_R在18和31范围内，RS＝0.5；如果RS_R大于31，RS＝1；结果评估：RS为0，属于低风险范围，复发风险低，化疗获益小；RS为1属于高风险范围，复发风险高，化疗获益高；RS为0.5属于中风险范围；RS_R值越大，平均远处复发率越高。