[发明专利]陆地棉4号染色体与纤维强度相关的SNP分子标记

摘要

本发明属于棉花分子育种技术领域，公开了一种与陆地棉纤维强度相关的SNP分子标记及其检测和应用。所述的SNP分子标记是以棉花稳定的RIL群体为材料，通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些SNP标记，进行分子标记辅助育种选择，可大大缩短育种周期，提高棉花纤维强度的育种效率。

主权项

一种与陆地棉纤维高强度基因连锁的SNP标记，其定位在与纤维强度相关的6个QTL中，其中有4个在多环境下检测稳定，这些QTL都位于陆地棉4号染色体上，有3个能够筛选得到分型较好的SNP标记，其中与qFS‑chr04‑2连锁的SNP标记为CRI‑SNP‑198739、CRI‑SNP‑198740、CRI‑SNP‑198741、CRI‑SNP‑198742；与qFS‑chr04‑3连锁的SNP标记为CRI‑SNP‑198743、CRI‑SNP‑198744、CRI‑SNP‑198745、CRI‑SNP‑198746、CRI‑SNP‑198747、CRI‑SNP‑198748、CRI‑SNP‑198749、CRI‑SNP‑198750、CRI‑SNP‑198751、CRI‑SNP‑198752、CRI‑SNP‑198753、CRI‑SNP‑198754、CRI‑SNP‑198755、CRI‑SNP‑198756、CRI‑SNP‑198757、CRI‑SNP‑198758、CRI‑SNP‑198759、CRI‑SNP‑198760、CRI‑SNP‑198761、CRI‑SNP‑198762、CRI‑SNP‑198763、CRI‑SNP‑198764、CRI‑SNP‑198765、CRI‑SNP‑198766、CRI‑SNP‑198767、CRI‑SNP‑198768、CRI‑SNP‑198769、CRI‑SNP‑198770；与qFS‑chr04‑5连锁的SNP标记为CRI‑SNP‑198771、CRI‑SNP‑198772：所述的SNP分子标记在染色体上的位置，和突变碱基如下表所示：标记名称SNP位点突变碱基CRI‑SNP‑1987397700054T/CCRI‑SNP‑1987407720338T/CCRI‑SNP‑1987417721630G/TCRI‑SNP‑1987428177782A/GCRI‑SNP‑1987438254082T/GCRI‑SNP‑1987448254072T/CCRI‑SNP‑1987458260415C/TCRI‑SNP‑1987468297320C/TCRI‑SNP‑1987478356357G/ACRI‑SNP‑1987488442751A/TCRI‑SNP‑1987498817947C/TCRI‑SNP‑19875010632971G/TCRI‑SNP‑19875110678536T/CCRI‑SNP‑19875210678492T/GCRI‑SNP‑19875310707374G/ACRI‑SNP‑19875410697252C/TCRI‑SNP‑19875510730252A/TCRI‑SNP‑19875610794756T/ACRI‑SNP‑19875710733643T/CCRI‑SNP‑19875810745098G/ACRI‑SNP‑19875910745115A/GCRI‑SNP‑19876010761125A/GCRI‑SNP‑19876110750539T/CCRI‑SNP‑19876210750815C/TCRI‑SNP‑19876310758631A/GCRI‑SNP‑19876410842788G/ACRI‑SNP‑19876510890616G/ACRI‑SNP‑19876610890596C/TCRI‑SNP‑19876710890290A/GCRI‑SNP‑19876810863195G/TCRI‑SNP‑19876910843048G/ACRI‑SNP‑19877010874601G/ACRI‑SNP‑19877144993167T/CCRI‑SNP‑19877245071666T/C                                                             。