[发明专利]基于周期三临近特征的外显子预测方法

摘要

本发明涉及基因编码序列(外显子)的预测，提出了一种周期三临近特征外显子预测方法。针对现有的DNA序列周期三外显子预测方法存在的易漏检、检测效率低的问题，本专利旨在提出一种基于周期三临近特征的外显子预测方法，提取了周期三临近功率谱特征值作为有效指标，因此该算法更具有通用性，且预测精度更高。

主权项

基于周期三临近特征的外显子预测方法，包括如下步骤：步骤1、训练阶段：选取已知的DNA序列，记录长度区间，建立DNA碱基序列的功率谱，并分别选取3倍数的外显子和内因子序列计算模板功率谱特征值；步骤2、识别阶段：取待识别DNA序列，滑动与训练阶段同样的长度区间，计算得到每组识别功率谱特征值；步骤3、计算训练阶段模板的功率谱特征值与识别阶段的每组识别功率谱特征值的欧式距离，对1/3频率的临近区间进行距离判断；步骤4、根据模板功率谱特征值与识别功率谱特征值的欧式距离，判断外显子位置。