[发明专利]一种基于Cpf1的DNA体外拼接方法有效

专利信息
申请号: 201610877438.7 申请日: 2016-09-30
公开(公告)号: CN107881184B 公开(公告)日: 2021-08-27
发明(设计)人: 王金;雷超;赵国屏 申请(专利权)人: 中国科学院分子植物科学卓越创新中心
主分类号: C12N15/63 分类号: C12N15/63;C12N15/10;C12P19/34
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 崔佳佳;马莉华
地址: 200032 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种基于Cpf1的DNA体外拼接方法。所述方法通过设计并合成能够被CRISPR‑Cpf1识别的特异crRNA序列来引导Cpf1特异地将双链DNA的特定位置切开并生成预设的粘性末端。利用本发明的方法,可方便、快捷、准确地获得预定的粘性末端,对DNA进行拼接。使用本发明的方法能够对DNA进行工程化、标准化、模块化的改造或组装。
搜索关键词: 一种 基于 cpf1 dna 体外 拼接 方法
【主权项】:
一种核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物包括:(a)第一核酸构建物,所述第一核酸构建物为双链DNA构建物,并且所述第一核酸构建物的序列中含有至少一个式I所示的Cpf1识别切割元件;D1‑D2‑D3   (I)式中,D1为前间区序列邻近基序PAM;D2为长度N2个核苷酸的Cpf1识别区,其中,N2为正整数14、15、16或17;D3为长度为N3个核苷酸的Cpf1切割区,其中,N3为4‑10的正整数;以及(b)第二核酸构建物,所述第二核酸构建物为RNA构建物,并且所述所述第二核酸构建物为结构如式II所示的crRNA元件;R1‑R2‑R3   (II)式中,R1为5'的发夹区;R2为长度M2个核苷酸的、与D2互补的Cpf1识别引导区,其中M2为正整数14、15、16或17;R3为无、或长度为M3个核苷酸的切割定位区,其中M3为1‑20的正整数;并且,所述的D3的序列与所述R3的序列是不匹配的。
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