[发明专利]一种用于分析大豆种质遗传完整性的方法有效

专利信息
申请号: 201610801333.3 申请日: 2016-09-05
公开(公告)号: CN106399491B 公开(公告)日: 2019-09-06
发明(设计)人: 王栋;张晓冬;李润芳;李湛;李群;田茜;戴双;丁汉凤;王效睦;谷晓红 申请(专利权)人: 山东省农作物种质资源中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 济南诚智商标专利事务所有限公司 37105 代理人: 朱彩霞
地址: 250101 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明提供一种用于分析大豆种质遗传完整性的方法,综合采用形态标记与SSR分子标记相结合的方法,且形态标记分析单株与SSR标记分析单株是一一对应的关系,即每个群体内进行农艺性状调查的单株同时也是进行SSR核心引物扩增的单株。本发明对大豆不同生活力的亲代群体及其子代群体的单株进行形态性状调查,并进行显著性差异分析;利用20对核心SSR引物进行DNA扩增检测,进行等位基因频率和群体遗传结构的显著性差异分析。若差异达到显著或极显著水平,则认为种质遗传完整性发生了改变。本发明提供的方法适用于大豆种质遗传完整性研究,应用该方法可以更准确地得出大豆种质的繁殖更新发芽率阈值。
搜索关键词: 单株 大豆种质 遗传完整性 分析 显著性差异 形态标记 等位基因频率 群体遗传结构 核心SSR引物 发芽率 农艺性状 显著水平 形态性状 种质遗传 子代群体 生活力 扩增 群体 大豆 调查 繁殖 检测 更新 应用 研究
【主权项】:
1.一种用于分析大豆种质遗传完整性的方法,其特征是,采用形态标记分析与SSR标记分析相结合:对大豆不同生活力群体及其后代群体单株进行农艺性状调查,计算出形态多样性指数,并进行显著性差异分析;利用SSR核心引物组对各群体单株的DNA进行扩增检测,计算出不同生活力群体及其后代群体与对照群体之间的各位点等位基因频率、每位点等位基因数、遗传多样性指数和香农指数,对各处理群体与对照群体之间的各位点等位基因频率进行χ2检验,对每位点等位基因数、遗传多样性指数和香农指数进行显著性t检验;所述形态标记分析与SSR标记分析在同一群体同一单株上进行;所述SSR标记分析的分析样本的采集是在不同生活力亲代群体及其子代群体在田间繁殖更新期间,子代采集叶片的单株与其亲代是一一对应关系;所述SSR核心引物组由20个引物对组成:序列分别如SEQ ID No.1‑SEQ ID No.40所示;所述不同生活力群体的获得方法是采用人工倒序老化的方法,包括如下步骤:选取播种、田间管理、收获及成熟度一致的大豆种子,先放入人工气候箱中进行种子含水量平衡,平衡条件是45%RH,25℃,15天,使处理种子的含水量处于同一水平;然后用铝箔袋真空密封分装,放置于人工老化箱内40℃恒温老化;放置顺序采用倒序法,即人工老化时间最长的处理先放入进行老化,人工老化时间最短的最后放入进行老化,试验结束时一起取出;人工老化结束后在25℃下,将所有处理密封平衡2天。
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