[发明专利]一套猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记及其检测引物组和应用

摘要

本发明公开了一套猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记及其检测引物组和应用。本发明是利用猕猴桃基因组数据库存在的不同猕猴桃物种的测序序列，通过序列比对参考基因组的方式寻找高多样性的单核苷酸变异区域并形成单核苷酸分子标记初选集，在此基础上利用新型质谱仪基因分型平台对单核苷酸变异位点进行实验验证和基因型获取，通过与物种的关联分析筛选物种关联特异的单核苷酸标记，最终得到一套用于猕猴桃杂交资源亲本物种来源鉴定的分子标记，形成本发明的技术方案。猕猴桃杂交资源亲本的鉴定可促进对杂交资源性状和生物特性形成的理解，加速杂交资源的遗传评价和开发利用，有着重要的理论学术意义和较高的经济应用价值。

主权项

1.一种猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记的检测引物组，其特征在于，其包括：/nA、阔叶猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AL-1的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAL-1标记获取引物F：5’-ATGGAAGGTAGATGTTGCCG-3’，/nAL-1标记获取引物R：5’-GTCAGATGAGACTGAAGAAG-3’，/nAL-1标记延伸引物：5’-ggTGAAGAAGATTTATTCTCAATGTA-3’；/nB、葛枣猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AP-2的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAP-2标记获取引物F：5’-TGTGGCGATTGCCATAATGC-3’，/nAP-2标记获取引物R：5’-GGAAGCGATTTGCATCTCTC-3’，/nAP-2标记延伸引物：5’-aGTTGAGACACCTTCGATATA-3’；/nC、软枣猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AA-3的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAA-3标记获取引物F：5’-CTGCTCTCCCGATTTCTATC-3’，/nAA-3标记获取引物R：5’-CATCAAATTAGTGGAAGTCCC-3’，/nAA-3标记延伸引物：5’-catccAATTAGTGGAAGTCCCTACAAC-3’；/nD、刺毛猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AS-4的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAS-4标记获取引物F：5’-GCACTTAGTTGCAAGCAATC-3’，/nAS-4标记获取引物R：5’-GTTCTCGTATGTTAGCTTTGG-3’，/nAS-4标记延伸引物：5’-ccccAGCTTTGGCTTTTTAGTAA-3’；/nE、中华猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AC-5的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAC-5标记获取引物F：5’-GAGTGTTCTGGCCTAGAAAG-3’，/nAC-5标记获取引物R：5’-TACGGGTCAAAACCAAACCT-3’，/nAC-5标记延伸引物：5’-gcaacACCAAACCTTTATTGCACCAA-3’；/nF、长叶猕猴桃物种关联特异单核苷酸分子标记AH-6的检测引物组，包括获取引物和延伸引物，具体为：/nAH-6标记获取引物F：5’-GTGCAAAAGGCTTACGGTTG-3’，/nAH-6标记获取引物R：5’-TCAAGTCCTGAGGTTGGTTC-3’，/nAH-6标记延伸引物：5’-ggCCATAAATATTATGGACGGATT-3’。/n