[发明专利]一种二代序列和三代单分子实时测序序列联合组装方法和系统有效
| 申请号： | 201610741984.8 | 申请日： | 2016-08-26 |
| 公开（公告）号： | CN107784198B | 公开（公告）日： | 2021-06-15 |
| 发明（设计）人： | 邓天全;贺丽娟;杨林峰;刘亚斌 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 孙银行;彭家恩 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种二代序列和三代单分子实时测序序列联合组装方法和系统，该方法包括：二代序列组装获得一级二代基因组骨架序列；二代序列对一级二代基因组骨架序列进行补洞，获得二级二代基因组骨架序列；三代单分子实时测序序列对二代基因组骨架序列进行补洞，获得一级二三代骨架序列；自纠错后的三代单分子实时测序序列利用与一级二三代骨架序列相互重叠关系进行拼接，获得二级二三代骨架序列；二代序列与二级二三代骨架序列进行比对获得无效比对区域，并用无效序列对该区域进行替换，获得三级二三代骨架序列；用二代序列对三级二三代骨架序列进行补洞，获得最终基因组组装序列。本发明的方法能够提高基因组组装的指标和准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 二代 序列 三代单 分子 实时 联合 组装 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种二代序列和三代单分子实时测序序列联合组装方法，其特征在于，所述方法包括：二代序列组装获得一级二代基因组骨架序列；所述二代序列对所述一级二代基因组骨架序列进行补洞，获得二级二代基因组骨架序列；三代单分子实时测序序列对所述二代基因组骨架序列进行补洞，获得一级二三代骨架序列；自纠错后的三代单分子实时测序序列利用与所述一级二三代骨架序列相互重叠关系进行拼接，获得二级二三代骨架序列；所述二代序列与所述二级二三代骨架序列进行比对获得无效比对区域，并用无效序列对该区域进行替换，获得三级二三代骨架序列；用所述二代序列对所述三级二三代骨架序列进行补洞，获得最终基因组组装序列。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳华大基因科技服务有限公司，未经深圳华大基因科技服务有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201610741984.8/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：一种防烫伤的烫斗
- 下一篇：结合物联网技术的脏衣管理清洁系统与方法
