[发明专利]一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法在审
申请号: | 201610371015.8 | 申请日: | 2016-05-28 |
公开(公告)号: | CN106021989A | 公开(公告)日: | 2016-10-12 |
发明(设计)人: | 刘文斌;沈良忠 | 申请(专利权)人: | 温州大学 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 温州名创知识产权代理有限公司 33258 | 代理人: | 陈加利 |
地址: | 325000 浙江省温州市瓯海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明实施例公开了一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法,该方法包括:利用基因芯片采集技术获取生物样本基因的连续表达谱数据,并根据连续表达谱数据,构建初始基因调控网络;基于预设的基因关联性对初始基因调控网络进行删减调整,得到相关基因调控网络,并通过布尔函数对相关基因调控网络进行计算,得到相关基因调控网络的单吸引子;确定初始基因调控网络中目标基因的调控范围,并将目标基因的调控范围依据相关基因调控网络的单吸引子转化为复合布尔函数的吸引子,且进一步将转化的吸引子与细胞吸引子进行匹配来确定肿瘤细胞状态。实施本发明,能够对肿瘤基因有全面的认识,快速鉴定肿瘤,为肿瘤治疗研究提供一个有力的理论框架。 | ||
搜索关键词: | 一种 通过 布尔 网络 模拟 肿瘤 细胞 状态 方法 | ||
【主权项】:
一种通过布尔网络模拟肿瘤细胞状态的方法,其特征在于,所述方法包括:a、利用基因芯片采集技术获取生物样本基因的连续表达谱数据,并根据所述获取到的连续表达谱数据,构建布尔网络模型的初始基因调控网络;b、基于预设的基因关联性对所述初始基因调控网络进行删减调整,得到相关基因调控网络,并通过布尔函数对所述得到的相关基因调控网络进行计算,得到所述相关基因调控网络的单吸引子;c、确定所述初始基因调控网络中目标基因的调控范围,并将所述确定的目标基因的调控范围依据所述得到的相关基因调控网络的单吸引子转化为复合布尔函数的吸引子,且进一步将所述转化的吸引子与细胞吸引子进行匹配来确定肿瘤细胞状态。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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