[发明专利]一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测及分析平台

摘要

本发明创造提供了一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测及分析平台，包括假阳性分析模块、等位基因丢失率分析模块、过滤体细胞突变模块和体细胞突变筛选模块、单细胞异质性分析模块；所述假阳性分析模块、等位基因丢失率分析模块与过滤筛选体细胞突变模块连接，所述过滤筛选体细胞突变模块与所述单细胞异质性分析模块连接。本发明通过对单细胞突变位点假阳性率、等位基因丢失率的计算，过滤肿瘤中的体细胞突变，并分析单细胞之间的异质性，本发明根据单细胞基因组突变的假阳性情况论证测序结果的可靠性，能够检测单细胞实验技术的可靠性，能够对后续结果进行多功能分析。

主权项

1.一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测及分析平台，其特征在于：包括假阳性分析模块，用于计算单细胞基因组突变的假阳性率，单细胞假阳性越高，突变位点的可靠性越低；首先定义在组织测序和单细胞测序中都发现的突变为真阳性突变(TP mutation)，在组织测序中发现但是在单细胞中没有发现的突变是假阴性突变(FN mutation)，在单细胞中发现但是没有在组织测序中发现的突变是假阳性突变(FP mutation)，在组织测序中没有被识别成突变的位点为真阴性突变(TN mutation)，根据上述数据计算假阳性率FPR＝FP/(FP+TN)单细胞假阳性越高，突变位点的可靠性越低；等位基因丢失率分析模块，包括杂合性突变位点检测模块、纯合性突变位点检测模块，等位基因丢失率分析模块用于计算单细胞基因组突变的等位基因丢失率，等位基因丢失率越高，突变位点的可靠性越低；首先定义在组织数据中突变频率小于95％的位点是杂合性突变，若杂合性突变位点的突变频率大于或等于95％则为纯合性突变，通过杂合性突变位点检测模块提取杂合性突变位点，并通过纯合性突变位点检测模块找其对应的单细胞中是否变为纯合性突变，并计算在单细胞中变为纯合性突变的比例，该比例即为等位基因丢失率，等位基因丢失率越高，突变位点的可靠性越低；过滤筛选体细胞突变模块，用于过滤筛选肿瘤中的体细胞突变，并根据假阳性率、等位基因丢失率筛选可信度高的体细胞突变；单细胞异质性分析模块，用于分析单细胞的组内异质性；所述假阳性分析模块、等位基因丢失率分析模块与过滤筛选体细胞突变模块连接，所述过滤筛选体细胞突变模块与所述单细胞异质性分析模块连接。