[发明专利]识别生物分子网络中关键模块或关键节点的方法

摘要

本发明提供了一种针对生物分子的复杂网络，如蛋白质相互作用网络、基因表达调控网络、生物代谢网络、表观遗传网络、表型网络、信号传导网络，基于其拓扑结构融合多种方法进行关键模块和关键节点的方法，主要步骤如下：基于生物分子网络，或对网络进行模块的划分，对网络或各模块，基于网络拓扑结构采用多种度量方法多角度综合定量识别关键模块和关键节点。

主权项

1.一种识别网络中关键节点的方法，所述方法包括以下步骤：(1)以节点数目≥3为标准，对生物分子网络进行模块识别，所述生物分子网络为疾病相关的蛋白质相互作用网络，由≥2000个节点和≥6000条边组成；(2)对于经步骤(1)识别的模块，基于模块之间的组件相关性构建加权或不加权的模块相互作用网络；(3)对于经步骤(2)构建的加权或不加权的模块相互作用网络，采用至少3种度量节点重要性的方法识别关键模块，其中所述关键模块满足以下条件：根据所述度量节点重要性的方法进行计算，得到的数值按降序排列(A)在至少一种所述度量节点重要性的方法中排名第一；和(B)在所有所述度量节点重要性的方法中排名前三之一，所述度量节点重要性的方法选自：度中心性方法、邻近中心性方法、特征向量中心性方法、介数中心性方法、子图中心性方法、枢纽中心性方法、控制中心性方法、节点强度方法、应力中心性方法、页面等级方法和邻接矩阵谱方法；(4)对于经步骤(3)识别的关键模块，采用至少3种度量节点重要性的方法识别所述关键模块中的关键节点，其中所述关键节点满足以下条件：根据所述度量节点重要性的方法进行计算，得到的数值按降序排列(A)在至少一种所述度量节点重要性的方法中排名第一；和(B)在所有所述度量节点重要性的方法中排名前三之一，所述度量节点重要性的方法选自：度中心性方法、邻近中心性方法、特征向量中心性方法、介数中心性方法、子图中心性方法、枢纽中心性方法、控制中心性方法、节点强度方法、应力中心性方法、页面等级方法和邻接矩阵谱方法。