[发明专利]一种确定核酸序列的方法及系统有效
| 申请号： | 201610193219.7 | 申请日： | 2016-03-30 |
| 公开（公告）号： | CN105950707A | 公开（公告）日： | 2016-09-21 |
| 发明（设计）人： | 张印新;韩颖鑫;王佳伟;高晓峘;张春生;李胜 | 申请（专利权）人： | 广州精科生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/22 |
| 代理公司： | 深圳市赛恩倍吉知识产权代理有限公司 44334 | 代理人： | 彭辉剑 |
| 地址： | 510663 广东省广州市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种确定核酸序列的方法，包括，获取待测样本中的核酸，对所述核酸进行测序，获得由多个测序序列构成的测序结果；将所述测序结果进行过滤，所述过滤包括去除不确定碱基比例大于1%的读段和/或碱基质量值不大于5的碱基数的比例不小于50%的读段，获得过滤后的测序结果；将所述过滤后的测序结果与第一数据库进行第一比对，获得第一比对结果；以及将所述第一比对结果与第二数据库进行第二比对，获得第二比对结果；分析所述第二比对结果，确定待测样本的核酸序列。本发明还提供一种确定核酸序列的系统。本发明基于生物信息学分析手段与强大的数据库平台来对样本中的微生物种类进行鉴定，具有结果灵敏、特异性强等优点。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 确定 核酸 序列 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种确定核酸序列的方法，其特征在于，包括，（1）获取待测样本中的核酸，对所述核酸进行测序，获得由多个测序序列构成的测序结果；（2）将所述测序结果进行过滤，所述过滤包括去除不确定碱基比例大于1%的读段和/或碱基质量值不大于5的碱基数的比例不小于50%的读段，获得过滤后的测序结果；（3）将所述过滤后的测序结果与第一数据库进行第一比对，获得第一比对结果；以及（4）将所述第一比对结果与第二数据库进行第二比对，获得第二比对结果；（5）分析所述第二比对结果，确定待测样本的核酸序列。
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