[发明专利]利用高分辨熔解曲线检测菌群的分析方法在审

专利信息
申请号: 201610047905.3 申请日: 2016-01-25
公开(公告)号: CN105803058A 公开(公告)日: 2016-07-27
发明(设计)人: 徐锋;杨栋;魏华;武晓丽;蔚晓敏;吴姚平 申请(专利权)人: 南昌大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南昌新天下专利商标代理有限公司 36115 代理人: 施秀瑾
地址: 330031 江西省*** 国省代码: 江西;36
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摘要: 发明公开了一种利用高分辨熔解曲线检测菌群的分析方法,所述方法包括以下步骤:目标菌DNA提取;通过设计引物使目标菌DNA的PCR扩增;对目标菌DNA的PCR产物进行DGGE分析;在PCR产物中加入DNA变性剂,进行HRM分析:DNA变性剂为尿素、甲酰胺和盐酸胍,其中,尿素和甲酰胺均能使Tm值降低,盐酸胍则使Tm值升高,使目标菌的PCR产物Tm值差异变大,峰型得以区分开;将分析结果与变性梯度凝胶电泳分析结果相对比,初步建立高分辨熔解曲线用于菌群种类分析的方法。本发明使用不同的DNA变性剂,使得不同DNA片段的Tm值差异变大,更便于区分,初步建立HRM用于菌群种类分析的新方法。
搜索关键词: 利用 分辨 熔解 曲线 检测 分析 方法
【主权项】:
一种利用高分辨熔解曲线检测菌群的分析方法,其特征在于,包括以下步骤:1)目标菌DNA提取;2)通过设计引物使目标菌DNA的PCR扩增;3)对目标菌DNA的PCR产物进行变性梯度凝胶电泳分析;4)在PCR产物中加入DNA变性剂,进行高分辨溶解曲线分析:所述DNA变性剂为尿素、甲酰胺和盐酸胍,其中,尿素和甲酰胺均能使Tm值降低,盐酸胍则使Tm值升高,使目标菌的PCR产物Tm值差异变大,峰型得以区分开;5)将步骤4)的分析结果与变性梯度凝胶电泳分析结果相对比,初步建立高分辨熔解曲线用于菌群种类分析的方法。
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