[发明专利]基于全局和局部层次最优的细胞跟踪方法在审

专利信息
申请号: 201610017579.1 申请日: 2016-01-12
公开(公告)号: CN105678810A 公开(公告)日: 2016-06-15
发明(设计)人: 沈红斌;孟姝 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: G06T7/20 分类号: G06T7/20
代理公司: 上海交达专利事务所 31201 代理人: 王毓理;王锡麟
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种图像处理领域的基于全局和局部层次最优的细胞跟踪方法,通过椭圆拟合初次分割得到的独立区域,识别出欠分割的粘连细胞,再使用小波变换方法进一步分割,计算分割后所有细胞的质心作为细胞唯一特征,使用二分图匹配方法对细胞的帧间关联,再分别对细胞移入、细胞移出、细胞分裂和细胞遮挡事件进行识别处理,循环匹配并得到不完整的细胞轨迹段,通过对细胞轨迹段分析识别纠错,最终基于局部最优生成完整细胞轨迹。本发明利用细胞的位置信息实现细胞分裂的子细胞关联,对不同的数据集具有良好的通用性。
搜索关键词: 基于 全局 局部 层次 最优 细胞 跟踪 方法
【主权项】:
1.一种基于全局和局部层次最优的细胞跟踪方法,其特征在于,通过椭圆拟合初次分割得到的独立区域,识别出欠分割的粘连细胞,再使用小波变换方法进一步分割,计算分割后所有细胞的质心作为细胞唯一特征,使用二分图匹配方法对细胞的帧间关联,再分别对细胞移入、细胞移出、细胞分裂和细胞遮挡事件进行识别处理,循环匹配并得到不完整的细胞轨迹段,通过对细胞轨迹段分析识别纠错,最终基于局部最优生成完整细胞轨迹;所述的识别处理是指:由于帧间细胞数量变化,二分图匹配为不完全匹配,存在未关联的点,对于未匹配的点,判断细胞质心距图像边界的最短距离:a.当小于距离阈值的一半,即L/2,则认为细胞移出或者移入了视野;b.当大于距离阈值的一半,且细胞位于前一帧时,认为细胞发生遮挡,选择当前帧最近的细胞匹配的下一帧细胞进行关联,作为细胞遮挡后的区域;c.当大于距离阈值的一半,且细胞位于后一帧时,认为发生细胞分裂,该细胞被认为是一个子细胞,在后一帧寻找可能的另一个已经匹配的子细胞。
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