[发明专利]一种模型自适应的NMR代谢组学数据归一化方法有效

专利信息
申请号: 201510084309.8 申请日: 2015-02-16
公开(公告)号: CN104615903B 公开(公告)日: 2017-05-03
发明(设计)人: 董继扬;邓伶莉 申请(专利权)人: 厦门大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 厦门南强之路专利事务所(普通合伙)35200 代理人: 马应森
地址: 361005 *** 国省代码: 福建;35
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要: 一种模型自适应的NMR代谢组学数据归一化方法,涉及核磁共振。1)数据获取;2)数据中心化和归一化系数初始化;3)归一化处理;4)多元统计分析;5)模型自适应归一化系数;6)循环迭代重复步骤3)~5),直至满足循环结束。通过在多元统计分析模型和最大化投影矢量与类别矢量相关系数之间进行循环迭代,不断调整归一化系数矢量,使得归一化后数据建立的多元统计分析模型能准确提取组间特征信息。模型自适应归一化方法能针对所选取的多元统计分析模型采用合适的归一化系数矢量,是一种自适应的归一化方法。相对于以往基于数据的归一化方法,该方法更灵活、有效,能有效保持谱数据的结构信息。
搜索关键词: 一种 模型 自适应 nmr 代谢 数据 归一化 方法
【主权项】:
一种模型自适应的NMR代谢组学数据归一化方法,其特征在于包括以下步骤:1)数据获取:待检测的代谢组学生物样本,通过核磁共振波谱仪采获1H NMR谱;对1H NMR谱进行谱图编辑,得到待处理的NMR代谢组学数据;2)数据中心化和归一化系数初始化:待归一化的NMR代谢组学数据表示为X,其每一行表示一个样本谱,样本类别矢量表示为Y,分别对X和Y做中心化处理;归一化系数矢量记为s=[s1,s2,...,sd]T,初始化s为全1列矢量;3)归一化处理:Xs=X*diag(s)其中,diag(·)为对角矩阵变换符,即diag(s)表示生成一个以矢量s为对角元素,其它元素为0的对角矩阵;Xs为归一化后数据矩阵;4)多元统计分析:对归一化后的数据矩阵做多元统计分析,其负载矢量记为u;5)模型自适应归一化系数:最大化Xs在u上投影与类别矢量Y相关系数,即:max:r2=(cov(Xdiag(s)u,Y)std(Xdiag(s)u)*std(Y))2]]>利用梯度下降法更新s,s=s+η∂r2∂s]]>其中,∂r2∂s=2YTXdiag(s)u*YTdiag(u)*||Xdiag(s)u||F2-(YTXdiag(s)u)2*2sTdiag(u)XTXdiag(u)||Xdiag(s)u||F4*||Y||F2]]>其中,r表示相关系数;cov(·)和std(·)分别为协方差和标准差计算符;为梯度运算符;η为常数,其取值范围为(0,1);6)循环迭代:重复步骤3)~5),直至满足循环结束,其中,||·||为矢量模运算符;ε为自定义常数。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于厦门大学,未经厦门大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201510084309.8/,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top