[发明专利]与烟草株高发育性状紧密连锁分子标记的获得方法

摘要

本发明公开了一种与烟草株高发育性状紧密连锁分子标记的获得方法，建立一种获得烟草株高发育性状紧密连锁分子标记的新方法，包括烟草株高性状的表型获得；基于连锁分析的烟草主效QTL定位；以及基于关联分析的烟草株高QTL定位。本发明建立了一种烟草株高形态发育紧密连锁分子标记发掘的方法，同时在国际上首次在烟草12号连锁群上定位到一个新的影响株高发育的主效QTL，发现一个与之紧密连锁的分子标记PT55174。建立的数量性状主效QTL发掘方法和鉴定的分子标记对烟草株高主效基因的克隆和新品种选育具有重要意义。

主权项

一种与烟草株高发育性状紧密连锁分子标记的获得方法，其特征在于，建立一种获得烟草株高发育性状紧密连锁分子标记的新方法，包括以下步骤：A)获得烟草株高性状的表型，在不同年份和不同地点在始花期调查株高性状；B)基于连锁分析的烟草主效QTL定位，其中包括：1)采用CTAB方法提取亲本和群体基因组DNA，2)根据表型鉴定结果，从F₂群体中各选取极端高和极端低的10个单株个体，等量混合DNA，构建两个极端池，进而在双亲及两个极端池间筛选与目标性状连锁的SSR分子标记，鉴定出的标记进一步在整个F₂群体中分析基因型，3)主效QTL定位分析，利用F₂群体SSR基因型，结合F₂和F_2：3两年表型数据，进行QTL定位，利用的分析软件为Icimapping3.2，LOD阈值设为2.5，当某一位点的LOD值大于2.5时即认为该处存在一个显著QTL位点，采用的统计学方法为完备区间作图法，并估算相关遗传参数，相关遗传参数包括QTL位置、加性效应、对表型变异的加性贡献率和显性贡献率；C)基于关联分析的烟草株高QTL定位，根据连锁分析定位结果，在所在区间加密SSR标记，利用加密的SSR标记分析自然群体，结合连续两年不同地点的表型数据，进行关联分析作图，对相关QTL位点进行关联分析验证，同时进一步缩小QTL所在标记区间位置，发掘影响烟草株高性状的主效QTL紧密连锁的分子标记。