[发明专利]一种获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码全序列的方法在审
| 申请号： | 201410620497.7 | 申请日： | 2014-11-06 |
| 公开（公告）号： | CN105624145A | 公开（公告）日： | 2016-06-01 |
| 发明（设计）人： | 亓海刚;苗国英;李莉;阙华勇;张国范 | 申请（专利权）人： | 中国科学院海洋研究所 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10 |
| 代理公司： | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人： | 周秀梅;李颖 |
| 地址： | 266071*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明涉及生物信息和分子生物学领域，具体说是一种获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区全序列的方法。从NCBI获得栉孔扇贝转录组表达序列，对获得的序列进行拼接组装处理，处理后获得局部比对数据库，利用已知现有生物报道的凋亡抑制蛋白序列与上述局部比对数据库进行比对获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码片段；利用上述获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码片段根据基因片段设计扩增引物YF1和YF2，获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区序列；根据获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区序列的5'端和3'端，设计相应的扩增引物，分别进行凋亡抑制蛋白基因编码序列的5'端和3'端延伸扩增，扩增后利用重叠片段法进行连接，获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区全长序列。本发明提供的方法能快速经济获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白相关基因编码序列。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 获得 扇贝 抑制 蛋白 基因 编码 序列 方法 | ||
【主权项】：
一种获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码全序列的方法，其特征在于:从NCBI获得栉孔扇贝转录组表达序列，对获得的序列进行拼接组装处理，处理后获得局部比对数据库，利用已知现有生物报道的凋亡抑制蛋白序列与上述局部比对数据库进行比对获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码片段；利用上述获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码片段根据基因片段设计扩增引物YF1和YF2，获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区序列；根据获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区序列的5'端和3'端，设计相应的扩增引物，分别进行凋亡抑制蛋白基因编码序列的5'端和3'端延伸扩增，扩增后利用重叠片段法进行连接，获得栉孔扇贝凋亡抑制蛋白基因编码区全长序列。
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