[发明专利]大豆SHMT新等位基因及其分型方法在审
申请号: | 201410429922.4 | 申请日: | 2014-08-28 |
公开(公告)号: | CN104293806A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
发明(设计)人: | 袁翠平;董英山;王玉民;赵洪锟;刘晓冬;张玲;王英南 | 申请(专利权)人: | 吉林省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12Q1/68 |
代理公司: | 吉林长春新纪元专利代理有限责任公司 22100 | 代理人: | 王薇 |
地址: | 130033 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | 本发明涉及一种大豆SHMT新等位基因及其分型方法,属于植物基因资源和基因分型方法,其特征在于:野生大豆种质ZYD03685中的SHMT新等位基因型C的基因序列及检测该等位基因的分子标记的方法,本发明公开了SHMT(Genbank登录号为JQ714083.1)3504SNP位点为三等位性位点(T/A/C),野生大豆种质ZYD03685为新SNP等位基因型C;通过PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳即可检测出C基因型的纯合体或杂合体。野生大豆种质ZYD03685高抗胞囊线虫3号和6号生理小种,其根系胞囊数分别为1.3和0.7,换算成胞囊指数分别为1.4和0.7。 | ||
搜索关键词: | 大豆 shmt 等位基因 及其 方法 | ||
【主权项】:
大豆SHMT新等位基因,其特征在于:根据SHMT参照序列(Genbank登录号JQ714083.1),设计PCR引物,在高抗胞囊线虫3号和6号生理小种的野生大豆种质ZYD03685中克隆到SHMT并测序,通过与参照序列比较,在SHMT(Genbank登录号JQ714083.1)3504 SNP位点发现了新等位基因型C,编码氨基酸His,野生大豆种质ZYD03685 SHMT核苷酸序列具有如下特征:DNA水平1344位置和cDNA水平1072位置的碱基为C,编码的氨基酸为His(CAT); 核苷酸序列(DNA水平)![]()
表明野生大豆种质ZYD03685 SHMT参与了野生大豆对大豆胞囊线虫3号生理小种的抗性。
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