[发明专利]对柑桔大实蝇进行亲缘关系和聚类分析的分子标记方法有效
申请号: | 201410315887.3 | 申请日: | 2014-07-03 |
公开(公告)号: | CN104087664A | 公开(公告)日: | 2014-10-08 |
发明(设计)人: | 刘浩强;冉春;李鸿筠;丛林;胡军华;姚廷山 | 申请(专利权)人: | 西南大学柑桔研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 重庆市前沿专利事务所(普通合伙) 50211 | 代理人: | 谭春艳 |
地址: | 400712 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | 本发明一种对柑桔大实蝇进行亲缘关系和聚类分析的分子标记方法,属于分子标记技术领域。本发明利用7条RAPD引物和10对SRAP引物组合对柑桔大实蝇DNA进行PCR扩增,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳并拍照记录结果,统计被检测材料的扩增带;用遗传分析软件进行分析,获得个体之间的遗传距离,根据个体间的遗传距离聚类结果,绘制不同地理种群柑桔大实蝇的聚类图,区分不同的类群。本发明反应稳定、扩增片段清楚、多态性高,构建了柑桔大实蝇种群遗传多样性的分子反应体系,能揭示其种群间的遗传多样性,能快速、准确地对柑桔大实蝇进行聚类分析,区分不同的种群,对于监测及防治柑桔大实蝇有重要意义。 | ||
搜索关键词: | 柑桔大实蝇 进行 亲缘 关系 聚类分析 分子 标记 方法 | ||
【主权项】:
一种对柑桔大实蝇进行亲缘关系和聚类分析的分子标记方法,其特征在于:包括如下步骤:(1)提取待测柑桔大实蝇样品的DNA,保存备用;(2)用7条RAPD引物对步骤1得到的DNA分别进行PCR扩增,所述的7条RAPD引物名称和序列如下:1:ACGCCAGAGG,2:GAGCGAGGCT,3:CAGGGGTGGA,4:GGTCTGGTTG,S75:GACGGATCAG,Y06:AAGGCTCACC,Y18:GCTGAGTCAG;(3)用10对SRAP引物组合对步骤1得到的DNA分别进行PCR扩增,所述的10对SRAP引物组合名称为:3F‑1R,3F‑2R,9F‑1R,9F‑3R,9F‑2R,9F‑11R,4F‑10R,12F‑11R,10F‑3R,10F‑10R;其中,所述各引物序列如下:
(4)将步骤2、3得到的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳并拍照记录结果,统计被检测材料的扩增带,有带计为“1”,无带计为“0”,强带和弱带均计为“1”,组成“0‑1”数据矩阵;用遗传分析软件进行分析,获得个体之间的遗传距离,根据个体间的遗传距离聚类结果,绘制不同地理种群柑桔大实蝇的聚类图,区分不同的类群。
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