[发明专利]数据缺失下时间序列相似性度量方法有效
申请号: | 201410095671.0 | 申请日: | 2014-03-14 |
公开(公告)号: | CN103886195A | 公开(公告)日: | 2014-06-25 |
发明(设计)人: | 祁宏生;王殿海;许骏;叶盈;韦薇;郑正非;蔡正义 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 杜军 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种能够适应缺失数据的时间序列相似性度量方法。该方法从原始的两个时间序列两两提取数据对,并根据数据缺失情况分为5种,分别计算一阶相似度区间;对一阶相似度区间,两两提取区间计算二阶相似度,并得到二阶相似度向量;最后对二阶相似度向量做平均,得到最终的两个时间序列的相似度。本发明能适应多种场景,方法简单,对数据完整性没有任何要求。 | ||
搜索关键词: | 数据 缺失 时间 序列 相似性 度量 方法 | ||
【主权项】:
1.数据缺失下时间序列相似性度量方法,其特征在于:假设针对两个时间序列Xi=(xi1,xi2...)和Xj=(xj1,xj2...),时间序列长度都是N,时间序列每个值都有上限x,下限为0,相似度计算方法如下:1)两两提取两个时间序列的数据对,设分别对两个时间序列提取第m和第n个数据,得到xjm,xjn和xim,xin,共有
对;且每一个数据的约束为
2)针对这
对数据中的每一对{xim,xin}和{xjm,xjn},分为如下五种情况考虑计算相似度区间,该区间称之为一阶相似度:(1)如果数据都不缺失,则按照下面的公式:s mn ′ ( { x im , x in } , { x jm , x jn } ) = x im x jm + x in x jn ( x jm ) 2 + ( x jn ) 2 ( x im ) 2 + ( x in ) 2 ]]> 最终的数据对相似度区间为:smn∈[smn′({xim,xin},{xjm,xjn}),smn′({xim,xin},{xjm,xjn})](2)如果数据都缺失,也即{xim,xin}={NaN,NaN}以及{xjm,xjn}={NaN,NaN},则:smn∈[1,1](3)如果数据只有一个缺失,不失一般性,假设xjn=NaN,则按照余弦相似度计算思想,两个二元向量的相似度等于二维平面上两个向量的夹角余弦,当xjn空缺,由于xjn有上下限,从而,两个向量的夹角有一个最大值和最小值,从而相似度是一个也区间:smn∈[min(1,cos(Θ1),cos(Θ2)),max(1,cos(Θ1),cos(Θ2))]求得cos ( Θ 1 ) = x im ( x im ) 2 + ( x in ) 2 , cos ( Θ 2 ) = x im x jm + x in x ‾ ( x jm ) 2 + ( x ‾ ) 2 ( x im ) 2 + ( x in ) 2 ; ]]> (4)如果两个数据对都有数据缺失,且形式为{xim,xin}={xim,NaN}以及{xjm,xjn}={xjm,NaN},则相似度是一个区间:s mn ∈ [ 0 , max ( x im ( x im ) 2 + ( x ‾ ) 2 , x jm ( x jm ) 2 + ( x ‾ ) 2 ) ] ]]> (5)如果两个数据对都有一个缺失,且形式为{xim,xin}={xim,NaN}以及{xjm,xjn}={NaN,xjn};或者两个数据对共有三个缺失,形式为{xim,xin}={xim,NaN}以及{xjm,xjn}={NaN,NaN},有一个相似度区间:smn∈[0,1]3)将每一个smn区间统一表达为
表示区间起始值,
表示区间结束值,对
个相似度区间,再依次两两计算相似度,称之为二阶相似度;假设某一对相似度区间分别为
和
则它们的相似度smnkj为:s mnkj = s mn 1 s kj 1 + s mn 2 s kj 2 ( s mn 1 ) 2 + ( s kj 1 ) 2 ( s kj 1 ) 2 + ( s kj 2 ) 2 , ∀ m ≠ n , k ≠ j ]]> 可知,smnkj的个数为C N ( N - 1 ) 2 2 = N ( N - 1 ) 2 ( N ( N - 1 ) 2 - 1 ) 2 = N 4 - 2 N 3 - N 2 - 2 N + 2 8 ]]> 4)对二阶相似度向量求平均,最终两个时间序列相似度s(Xi,Xj)为:s ( X i , X j ) = Σ m ≠ nmk ≠ j s mnkj N 4 - 2 N 3 - N 2 - 2 N + 2 8 = 8 Σ m ≠ n , k ≠ j s mnkj N 4 - 2 N 3 - N 3 - 2 N + 2 ]]> 至此,两个缺失数据的时间序列相似度求出来了。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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