[发明专利]一种锈斑蟳微卫星标记的快速检测方法

摘要

本发明涉及一种锈斑蟳微卫星标记的快速检测方法，包括：（1）锈斑蟳基因组DNA的提取；（2）根据GeneBank数据库中锈斑蟳的功能基因序列，获得含有微卫星重复的基因序列；（3）微卫星标记引物的设计；（4）锈斑蟳不同个体的基因组DNA的PCR扩增；（5）PCR产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。本发明的检测方法具有快速、准确、灵敏等优点，能够直观地检测出锈斑蟳不同个体的基因型，从而快速获得锈斑蟳在功能基因微卫星位点遗传变异的多态性图谱，该微卫星标记可应用于锈斑蟳遗传变异与种群遗传多样性分析等领域。

主权项

一种锈斑蟳微卫星标记的快速检测方法，包括：（1）提取锈斑蟳基因组DNA；（2）根据GeneBank数据库中锈斑蟳的功能基因序列，获得含有微卫星重复的核心基因序列；序列如下所示：Xfe‑MIH‑1：如SEQ ID NO:1所示；Xfe‑MIH‑2：如SEQ ID NO:2所示；Xfe‑MIH‑3：如SEQ ID NO:3所示；（3）设计微卫星特异引物，具体如下：Xfe‑MIH‑1:F:TGCGAGACTCACTCAACACT        R:TTATGTTGTACACCGCTCCA        退火温度为55℃，核心重复序列为(CA)23；Xfe‑MIH‑2:F:CTTAGTTATTCCGTCCCGTTTA         R:TTAGCCCGCCCTATCTTCTC         退火温度为55℃，核心重复序列为(GT)4N6(GT)8GC(GT)2；Xfe‑MIH‑3:F:GTAGCGAAGGTACGAGAAGC         R:GAAGATCGGAAACAATGAGC         退火温度为56℃，核心重复序列为(GT)14；（4）利用上述引物对锈斑蟳不同个体的基因组DNA进行PCR扩增；（5）对PCR产物进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，从而获得锈斑蟳遗传变异的多态性图谱。