[发明专利]编辑家蚕基因组TALE重复区的高效组装方法及其骨架载体有效

专利信息
申请号: 201310049848.9 申请日: 2013-02-07
公开(公告)号: CN103131695A 公开(公告)日: 2013-06-05
发明(设计)人: 夏庆友;王峰;徐汉福;马三垣;王元成;袁林;赵萍;向仲怀 申请(专利权)人: 西南大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12N15/63
代理公司: 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 代理人: 赵荣之
地址: 400715*** 国省代码: 重庆;85
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摘要: 发明公开了编辑家蚕基因组TALE重复区的高效组装方法,具体为:先将含X个碱基的随机序列顺序编号,然后按编号分成Y个组,每组含有1-4个碱基;然后设计扩增TALE重复单元的引物对,该引物对含有无缝连接相邻TALE重复单元的II型限制性内切酶识别位点和特异接头,再利用设计的引物对分别以4种RVD重复单元为模板进行PCR扩增,得PCR产物库;将碱基数为X的靶序列按相同方法进行编号并分组,然后从PCR产物库中取与靶序列编号相同的并识别相应碱基的PCR产物,将同组的PCR产物混合后进行GoldenGate连接,然后将连接产物再进行GoldenGate连接,得含X个重复单元的TALE重复区;利用本发明的方法,不需要合成大量的DNA,成本低,能用于制备编辑家蚕基因组的TALE重复区。
搜索关键词: 编辑 家蚕 基因组 tale 重复 高效 组装 方法 及其 骨架 载体
【主权项】:
编辑家蚕基因组TALE重复区的高效组装方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)将含X个碱基的随机序列顺序编号,然后按编号顺序分成Y个组,每组含有1‑4个碱基;其中X大于或等于10;(2)设计扩增TALE重复单元的引物对,所述引物对含有无缝连接相邻TALE重复单元的II型限制性内切酶识别位点和特异接头,然后利用设计的引物对分别以4种TALE重复单元为模板进行PCR扩增,得PCR产物库;(3)将碱基数为X的靶序列按步骤(1)的方法进行编号并分组,然后从PCR产物库中取与所述靶序列编号相同的并识别相应碱基的PCR产物,将同组PCR产物混合后进行GoldenGate连接,然后将各组的连接产物再进行GoldenGate连接,得含X个重复单元的TALE重复区。
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