[发明专利]花色苷抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法有效

专利信息
申请号: 201310022097.1 申请日: 2013-01-21
公开(公告)号: CN103093100A 公开(公告)日: 2013-05-08
发明(设计)人: 敬璞;李平凡;钱柄俊;隋中泉;赵淑娟 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 上海旭诚知识产权代理有限公司 31220 代理人: 郑立
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法,所述方法以已知活性的花色苷抗氧化剂为研究对象,利用三维定量构效关系技术,建立花色苷抗氧化剂三维定量构效关系模型,采用分子力场法和分子相似性系数分析法分析、分子构象优化、参数优化等技术建立准确的构效关系模型。所构建模型能够快速预测未知活性化合物的活性值,并且能够合理阐释花色苷抗氧化活性大小与其结构特征的关系。
搜索关键词: 花色 氧化 活性 三维 定量 关系 模型 构建 方法
【主权项】:
一种花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法,包括以下步骤:(1)测定花色苷物质的抗氧化活性大小,并将其随机分组为测试集和训练集,生物活性指标采用抗氧化活性的负对数表示;(2)使用软件分析获得训练集和测试集中的化合物的三维空间结构,经构象优化获得优化的三维空间结构模型;(3)以步骤(2)中优化得到的三维空间结构模型的公共刚性骨架为基础,以训练集中抗氧化活性最大的分子为模板进行分子叠合;(4)用小分子探针搜寻叠合后化合物周围的力场信息计算力场值;(5)对步骤(4)获得的力场信息与训练集中的化合物的生物活性值进行偏最小二乘法回归,获得花色苷物质抗氧化活性三维定量构效关系模型。
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