[发明专利]基于蛋白质交互作用网络的异病同治分子机理分析方法有效
申请号: | 201210481014.0 | 申请日: | 2012-11-23 |
公开(公告)号: | CN103049678A | 公开(公告)日: | 2013-04-17 |
发明(设计)人: | 高一波;陈迪;卢朋;陈琳;刘西;代文;宋江龙 | 申请(专利权)人: | 中国科学院自动化研究所 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 宋焰琴 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种揭示异病同治分子机理的分析方法,用于分析不用疾病、相同治疗的分子机理,包括如下步骤:S1、构建不同疾病各自的蛋白质交互作用网络;S2、根据同治药物的化合物成分预测该同治药物中各化合物的潜在靶标,保留与所述疾病相关的基因对应靶标的化合物;S3、根据同治药物的化合物成分的潜在靶标在每一疾病的蛋白质交互作用网络中的分布对同治药物中各化合物进行聚类;S4、在所述聚类中的每个类簇中确定频繁出现的靶标组合;S5、对不同疾病的蛋白质交互作用网络中频繁出现的靶标对应的节点进行对比分析,以得到同治药物对所述至少两种疾病的分子机理。本发明能用于从分子层面对不同疾病的相同治疗原理的机理进行解释,特别有益于中医的异病同治理论在临床和中西医结合方面的运用和发展。 | ||
搜索关键词: | 基于 蛋白质 交互作用 网络 同治 分子 机理 分析 方法 | ||
【主权项】:
一种异病同治分子机理分析方法,用于分析同治药物实现异病同治的分子机理,所述同治药物是指可以同时治疗多个疾病的药物,其特征在于,包括如下步骤:S1、构建至少两种疾病各自的蛋白质交互作用网络;S2、根据所述同治药物的化合物成分预测该同治药物中各化合物的潜在靶标,保留与所述疾病相关的基因对应靶标的化合物;S3、根据所述同治药物的化合物成分的潜在靶标在每一疾病的蛋白质交互作用网络中的分布对同治药物中各化合物进行聚类;S4、在所述聚类中的每个类簇中确定频繁出现的靶标组合;S5、对所述疾病的蛋白质交互作用网络中频繁出现的靶标对应的节点进行对比分析,以得到该同治药物对所述至少两种疾病实现异病同治的分子机理。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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