[发明专利]多态性检测用探针、多态性检测方法、药效判定方法以及多态性检测用试剂盒

摘要

本发明涉及多态性检测用探针、多态性检测方法、药效判定方法以及多态性检测用试剂盒。具体地，本发明提供能够以高灵敏度、简便地检测PIK3CA基因的多态性的多态性检测用探针。所述多态性检测用探针为作为选自P1～P11’的至少一种荧光标记寡核苷酸的、用于检测PIK3CA基因的多态性的多态性检测用探针。

主权项

一种多态性检测用探针，其用于检测PIK3CA基因的多态性，所述多态性检测用探针为选自下述P1～P11’的至少一种荧光标记寡核苷酸，(P1)寡核苷酸，其相对于含有序列编号1～序列编号3的任一者所示的碱基序列中的第226位～第232位的碱基的、碱基长为7～50的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第226位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P1’)寡核苷酸，其与含有序列编号1～序列编号3的任一者所示的碱基序列中的第226位～第232位的碱基的、碱基长为7～50的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第226位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P2)寡核苷酸，其相对于含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第139位～第155位的碱基的、碱基长为17～50的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第139位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P2’)寡核苷酸，其与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第139位～第155位的碱基的、碱基长为17～50的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第139位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P3)寡核苷酸，其相对于含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第165位的碱基的、碱基长为11～50的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第165位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P3’)寡核苷酸，其与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第165位的碱基的、碱基长为11～50的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第165位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P4)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第167位的碱基的、碱基长为13～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第167位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P4’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第167位的碱基的、碱基长为13～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第167位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P5)寡核苷酸，其相对于与含有在序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第164位的碱基的、碱基长为10～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，且与第164位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P5’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第164位的碱基的、碱基长为10～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第164位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P6)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第163位的碱基的、碱基长为9～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第163位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P6’)寡核苷酸，其与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第163位的碱基的、碱基长为9～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第163位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P7)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第161位的碱基的、碱基长为7～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第161位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P7’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第161位的碱基的、碱基长为7～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第161位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P8)寡核苷酸，其相对于和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第160位的碱基的、碱基长为6～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第160位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P8’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第155位～第160位的碱基的、碱基长为6～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第160位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P9)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第144位～第155位的碱基的、碱基长为12～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第144位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P9’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第144位～第155位的碱基的、碱基长为12～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第144位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P10)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第148位～第155位的碱基的、碱基长为8～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第148位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；(P10’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第148位～第155位的碱基的、碱基长为8～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第148位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，该胞嘧啶用荧光染料标记；(P11)寡核苷酸，其相对于与含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第151位～第155位的碱基的、碱基长为5～50的碱基序列互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与第151位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记；以及(P11’)寡核苷酸，其与和含有序列编号4或序列编号5所示的碱基序列中的第151位～第155位的碱基的、碱基长为5～50的碱基序列互补的碱基序列的互补链在严格条件下杂交，与第151位的碱基对应的碱基为胞嘧啶，且该胞嘧啶用荧光染料标记。