[发明专利]生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备有效
| 申请号： | 201110414015.9 | 申请日： | 2011-12-13 |
| 公开（公告）号： | CN102495977A | 公开（公告）日： | 2012-06-13 |
| 发明（设计）人： | 任民;王志德;刘艳华;张兴伟;牟建民 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院烟草研究所 |
| 主分类号： | G06F19/24 | 分类号： | G06F19/24 |
| 代理公司： | 北京市盛峰律师事务所 11337 | 代理人： | 赵建刚 |
| 地址： | 266101 山东*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法，其特征在于，包括以下步骤：根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式；通过所述正则表达式分析待分析序列，判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR，如果判断结果为是，则输出所述目标SSR；如果判断结果为否，则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此，本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备，在对SSR发掘过程中，不会产生冗余结果，从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度，提高了SSR发掘的效率，降低了SSR发掘软件的开发难度。 | ||
| 搜索关键词： | 生物 基因组 简单 重复 序列 发掘 方法 设备 | ||
【主权项】：
一种生物基因组简单重复序列的发掘方法，其特征在于，包括以下步骤：根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式；通过所述正则表达式分析待分析序列，判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR，如果判断结果为是，则输出所述目标SSR；如果判断结果为否，则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。
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